Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRADDQ15628 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRADDQ15628 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRADDQ15628 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRADDQ15628 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRADDQ15628 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRADDQ15628 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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