Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BDH1Q02338 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BDH1Q02338 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BDH1Q02338 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BDH1Q02338 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BDH1Q02338 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms