Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS25P82663 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPS25P82663 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MRPS25P82663 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MRPS25P82663 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MRPS25P82663 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms