Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSK3BP49841 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSK3BP49841 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSK3BP49841 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSK3BP49841 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSK3BP49841 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms