Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GSK3BP49841 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GSK3BP49841 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GSK3BP49841 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GSK3BP49841 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GSK3BP49841 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GSK3BP49841 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GSK3BP49841 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GSK3BP49841 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GSK3BP49841 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GSK3BP49841 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GSK3BP49841 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GSK3BP49841 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GSK3BP49841 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GSK3BP49841 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GSK3BP49841 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GSK3BP49841 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSK3BP49841 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSK3BP49841 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GSK3BP49841 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GSK3BP49841 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSK3BP49841 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GSK3BP49841 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSK3BP49841 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSK3BP49841 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSK3BP49841 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSK3BP49841 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GSK3BP49841 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSK3BP49841 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSK3BP49841 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSK3BP49841 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GSK3BP49841 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GSK3BP49841 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GSK3BP49841 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GSK3BP49841 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GSK3BP49841 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GSK3BP49841 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GSK3BP49841 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GSK3BP49841 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSK3BP49841 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GSK3BP49841 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSK3BP49841 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSK3BP49841 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GSK3BP49841 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSK3BP49841 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSK3BP49841 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSK3BP49841 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSK3BP49841 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSK3BP49841 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSK3BP49841 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSK3BP49841 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSK3BP49841 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSK3BP49841 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSK3BP49841 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GSK3BP49841 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GSK3BP49841 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GSK3BP49841 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GSK3BP49841 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GSK3BP49841 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GSK3BP49841 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GSK3BP49841 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GSK3BP49841 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSK3BP49841 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GSK3BP49841 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GSK3BP49841 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GSK3BP49841 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GSK3BP49841 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GSK3BP49841 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GSK3BP49841 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GSK3BP49841 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GSK3BP49841 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GSK3BP49841 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GSK3BP49841 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GSK3BP49841 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GSK3BP49841 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GSK3BP49841 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GSK3BP49841 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GSK3BP49841 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GSK3BP49841 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSK3BP49841 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GSK3BP49841 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSK3BP49841 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms