Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT15P19012 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT15P19012 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT15P19012 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT15P19012 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT15P19012 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT15P19012 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT15P19012 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT15P19012 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT15P19012 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT15P19012 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT15P19012 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT15P19012 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT15P19012 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT15P19012 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT15P19012 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT15P19012 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT15P19012 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT15P19012 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT15P19012 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT15P19012 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT15P19012 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT15P19012 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT15P19012 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT15P19012 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT15P19012 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT15P19012 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT15P19012 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT15P19012 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT15P19012 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT15P19012 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT15P19012 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT15P19012 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT15P19012 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT15P19012 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT15P19012 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT15P19012 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT15P19012 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT15P19012 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT15P19012 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT15P19012 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT15P19012 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT15P19012 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT15P19012 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT15P19012 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT15P19012 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT15P19012 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT15P19012 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT15P19012 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT15P19012 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT15P19012 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT15P19012 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT15P19012 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT15P19012 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT15P19012 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT15P19012 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT15P19012 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT15P19012 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT15P19012 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT15P19012 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT15P19012 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT15P19012 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT15P19012 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT15P19012 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT15P19012 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT15P19012 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT15P19012 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT15P19012 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT15P19012 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT15P19012 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT15P19012 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT15P19012 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT15P19012 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT15P19012 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT15P19012 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT15P19012 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT15P19012 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT15P19012 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT15P19012 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT15P19012 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT15P19012 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT15P19012 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT15P19012 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT15P19012 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT15P19012 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT15P19012 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT15P19012 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms