Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KRT15P19012 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT15P19012 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KRT15P19012 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT15P19012 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KRT15P19012 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KRT15P19012 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
KRT15P19012 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KRT15P19012 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KRT15P19012 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT15P19012 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT15P19012 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT15P19012 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT15P19012 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT15P19012 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT15P19012 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT15P19012 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KRT15P19012 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT15P19012 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KRT15P19012 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KRT15P19012 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KRT15P19012 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KRT15P19012 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KRT15P19012 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KRT15P19012 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KRT15P19012 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KRT15P19012 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KRT15P19012 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
KRT15P19012 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
KRT15P19012 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KRT15P19012 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KRT15P19012 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KRT15P19012 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KRT15P19012 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
KRT15P19012 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KRT15P19012 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KRT15P19012 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KRT15P19012 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KRT15P19012 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KRT15P19012 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KRT15P19012 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KRT15P19012 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
KRT15P19012 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KRT15P19012 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KRT15P19012 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT15P19012 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT15P19012 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KRT15P19012 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT15P19012 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT15P19012 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT15P19012 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT15P19012 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT15P19012 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT15P19012 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT15P19012 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT15P19012 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT15P19012 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT15P19012 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT15P19012 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT15P19012 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KRT15P19012 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT15P19012 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT15P19012 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT15P19012 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KRT15P19012 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT15P19012 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT15P19012 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT15P19012 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT15P19012 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT15P19012 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KRT15P19012 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KRT15P19012 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT15P19012 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT15P19012 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KRT15P19012 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT15P19012 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KRT15P19012 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT15P19012 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT15P19012 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT15P19012 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT15P19012 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT15P19012 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT15P19012 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT15P19012 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT15P19012 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT15P19012 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT15P19012 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT15P19012 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT15P19012 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT15P19012 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT15P19012 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT15P19012 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT15P19012 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT15P19012 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT15P19012 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT15P19012 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT15P19012 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT15P19012 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KRT15P19012 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT15P19012 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms