Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL3O95236 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOL3O95236 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL3O95236 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL3O95236 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL3O95236 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL3O95236 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL3O95236 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOL3O95236 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL3O95236 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL3O95236 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL3O95236 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL3O95236 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOL3O95236 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL3O95236 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL3O95236 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL3O95236 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL3O95236 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOL3O95236 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOL3O95236 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOL3O95236 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOL3O95236 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL3O95236 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL3O95236 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL3O95236 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL3O95236 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOL3O95236 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOL3O95236 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOL3O95236 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOL3O95236 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOL3O95236 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOL3O95236 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOL3O95236 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL3O95236 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL3O95236 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL3O95236 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL3O95236 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOL3O95236 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOL3O95236 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOL3O95236 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOL3O95236 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL3O95236 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL3O95236 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOL3O95236 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL3O95236 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL3O95236 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL3O95236 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL3O95236 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOL3O95236 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL3O95236 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL3O95236 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOL3O95236 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL3O95236 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL3O95236 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL3O95236 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL3O95236 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOL3O95236 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOL3O95236 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOL3O95236 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOL3O95236 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOL3O95236 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOL3O95236 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOL3O95236 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOL3O95236 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOL3O95236 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL3O95236 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL3O95236 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL3O95236 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL3O95236 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL3O95236 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOL3O95236 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOL3O95236 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOL3O95236 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOL3O95236 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOL3O95236 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOL3O95236 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms