Protein–RNA interactions for Protein: O43309

ZSCAN12, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN12O43309 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZSCAN12O43309 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZSCAN12O43309 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZSCAN12O43309 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZSCAN12O43309 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZSCAN12O43309 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZSCAN12O43309 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms