Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRPO00591 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRPO00591 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRPO00591 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRPO00591 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRPO00591 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRPO00591 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRPO00591 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRPO00591 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRPO00591 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRPO00591 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRPO00591 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRPO00591 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRPO00591 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRPO00591 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRPO00591 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRPO00591 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRPO00591 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRPO00591 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRPO00591 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRPO00591 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRPO00591 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRPO00591 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRPO00591 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRPO00591 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRPO00591 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRPO00591 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRPO00591 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRPO00591 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRPO00591 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRPO00591 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRPO00591 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRPO00591 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRPO00591 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRPO00591 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRPO00591 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRPO00591 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRPO00591 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRPO00591 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRPO00591 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRPO00591 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRPO00591 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRPO00591 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRPO00591 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRPO00591 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRPO00591 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRPO00591 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRPO00591 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRPO00591 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRPO00591 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRPO00591 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRPO00591 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRPO00591 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRPO00591 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRPO00591 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRPO00591 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRPO00591 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRPO00591 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRPO00591 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRPO00591 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRPO00591 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRPO00591 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRPO00591 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRPO00591 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRPO00591 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRPO00591 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRPO00591 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRPO00591 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRPO00591 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRPO00591 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRPO00591 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRPO00591 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRPO00591 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRPO00591 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRPO00591 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRPO00591 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRPO00591 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRPO00591 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRPO00591 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRPO00591 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRPO00591 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRPO00591 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRPO00591 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRPO00591 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRPO00591 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRPO00591 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRPO00591 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRPO00591 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRPO00591 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRPO00591 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRPO00591 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRPO00591 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRPO00591 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRPO00591 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRPO00591 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRPO00591 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRPO00591 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRPO00591 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRPO00591 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRPO00591 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms