Protein–RNA interactions for Protein: O00168

FXYD1, Phospholemman, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD1O00168 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FXYD1O00168 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FXYD1O00168 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FXYD1O00168 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FXYD1O00168 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FXYD1O00168 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms