Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HDAC5-212ENST00000593013 1745 ntTSL 219.31■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PKP3-206ENST00000528036 940 ntTSL 221.69■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PKP3-210ENST00000533249 1111 ntTSL 321.19■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PKP3-205ENST00000527442 847 ntTSL 320.59■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PKP3-211ENST00000534401 756 ntTSL 320.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 RPA1-202ENST00000570451 630 ntTSL 319.6■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 318.49■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 UBE2Q1-207ENST00000497453 830 ntTSL 517.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 RPA1-203ENST00000571058 577 ntTSL 416.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PKP3-208ENST00000531857 687 ntTSL 415.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PKP3-209ENST00000533069 590 ntTSL 215.76■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 MGAT4B-218ENST00000521855 593 ntTSL 213.08□□□□□ -0.325e-8■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-201ENST00000465896 538 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 RPA1-201ENST00000254719 4340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 LAT-214ENST00000568440 419 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 GNL3-206ENST00000468885 263 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-202ENST00000466189 580 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-205ENST00000474275 2427 ntTSL 24.67□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-207ENST00000479467 987 ntTSL 23.97□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-204ENST00000472330 609 ntTSL 33.67□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-213ENST00000491258 719 ntTSL 1 (best)2.97□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-206ENST00000475729 772 ntTSL 52.84□□□□□ -1.952e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 PHC3-210ENST00000484931 657 ntTSL 52.77□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.653e-6■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-215ENST00000483342 1509 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-213ENST00000453698 1322 ntTSL 516.68■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-202ENST00000400436 2652 ntTSL 216.41■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-208ENST00000437028 1169 ntTSL 314.58□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-210ENST00000442419 741 ntTSL 311.54□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 SNHG11-214ENST00000457218 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-9■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 GRK2-210ENST00000531390 524 ntTSL 313.8□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 39.1
EFTUD2Q15029 NDRG2-228ENST00000554277 410 ntTSL 57.76□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 39
EFTUD2Q15029 RACK1-222ENST00000509535 456 ntTSL 38.17□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 39
EFTUD2Q15029 PUF60-206ENST00000526151 557 ntTSL 314.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 39
EFTUD2Q15029 ESYT1-210ENST00000551790 540 ntTSL 411.98□□□□□ -0.495e-24■■■■■ 39
EFTUD2Q15029 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 216.59■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 39
EFTUD2Q15029 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-10■■■■■ 39
EFTUD2Q15029 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.668e-20■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 RNH1-218ENST00000531149 709 ntTSL 315.55■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 212.98□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-13■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-13■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 PIEZO1-208ENST00000484567 2464 ntTSL 218.49■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 NT5DC2-209ENST00000478091 590 ntTSL 317.26■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 515.44■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 ARHGEF7-218ENST00000491775 581 ntTSL 410.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 C1orf35-206ENST00000491293 854 ntTSL 223.77■■□□□ 1.47e-8■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 COL16A1-201ENST00000373667 924 ntTSL 518.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 38.9
EFTUD2Q15029 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-9■■■■■ 38.8
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EFTUD2Q15029 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.06□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-209ENST00000591054 777 ntTSL 321.78■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-211ENST00000592514 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.35■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-206ENST00000590150 747 ntTSL 519.09■□□□□ 0.651e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MRPL4-208ENST00000590702 876 ntTSL 513.32□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.765e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 SNX4-203ENST00000471751 1308 ntTSL 218.77■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 SNX4-204ENST00000473417 754 ntTSL 317.4■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.682e-17■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.192e-17■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TERF2-205ENST00000566750 917 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-17■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TERF2-209ENST00000569280 513 ntTSL 59.25□□□□□ -0.932e-17■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TERF2-212ENST00000569611 556 ntTSL 48.97□□□□□ -0.972e-17■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TERF2-208ENST00000567841 554 ntTSL 48.34□□□□□ -1.072e-17■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 TMEM214-207ENST00000444135 919 ntTSL 514.13□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 CHRD-211ENST00000464833 1340 ntTSL 526.85■■□□□ 1.891e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 HDAC3-203ENST00000467533 663 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.241e-19■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 319.24■□□□□ 0.676e-9■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 MCM7-204ENST00000425308 1497 ntTSL 327.65■■■□□ 2.025e-10■■■■■ 38.8
EFTUD2Q15029 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 411.13□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 38.8
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