RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.31■■■■■ 5.96
PKP3-211ENST00000534401 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.56■■■■■ 5.04
PKP3-211ENST00000534401 ABCC9O60706 1549 aa45.51■■■■■ 4.88
PKP3-211ENST00000534401 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.81■■■■■ 4.6
PKP3-211ENST00000534401 NACADO15069 1562 aa43.8■■■■■ 4.6
PKP3-211ENST00000534401 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.62■■■■■ 4.57
PKP3-211ENST00000534401 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
PKP3-211ENST00000534401 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.48■■■■■ 4.55
PKP3-211ENST00000534401 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.38■■■■■ 4.53
PKP3-211ENST00000534401 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.86■■■■■ 4.45
PKP3-211ENST00000534401 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.57■■■■■ 4.41
PKP3-211ENST00000534401 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.49■■■■■ 4.39
PKP3-211ENST00000534401 SCRIBQ14160 1630 aa42.33■■■■■ 4.37
PKP3-211ENST00000534401 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.14■■■■■ 4.34
PKP3-211ENST00000534401 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.97■■■■■ 4.31
PKP3-211ENST00000534401 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
PKP3-211ENST00000534401 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.22■■■■■ 4.19
PKP3-211ENST00000534401 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.94■■■■■ 4.14
PKP3-211ENST00000534401 SMARCA4P51532 1647 aa40.58■■■■■ 4.09
PKP3-211ENST00000534401 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
PKP3-211ENST00000534401 NCAPD3P42695 1498 aa40.45■■■■■ 4.07
PKP3-211ENST00000534401 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.41■■■■■ 4.06
PKP3-211ENST00000534401 SMARCA2P51531 1590 aa40.33■■■■■ 4.05
PKP3-211ENST00000534401 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.29■■■■■ 4.04
PKP3-211ENST00000534401 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.29■■■■■ 4.04
PKP3-211ENST00000534401 HMGXB3Q12766 1538 aa40.21■■■■■ 4.03
PKP3-211ENST00000534401 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PKP3-211ENST00000534401 WIZO95785 1651 aa39.82■■■■□ 3.96
PKP3-211ENST00000534401 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.96
PKP3-211ENST00000534401 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
PKP3-211ENST00000534401 NESP48681 1621 aa39.4■■■■□ 3.9
PKP3-211ENST00000534401 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.33■■■■□ 3.89
PKP3-211ENST00000534401 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.21■■■■□ 3.87
PKP3-211ENST00000534401 ERCC6Q03468 1493 aa39.17■■■■□ 3.86
PKP3-211ENST00000534401 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.05■■■■□ 3.84
PKP3-211ENST00000534401 CFTRP13569 1480 aa38.99■■■■□ 3.83
PKP3-211ENST00000534401 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.96■■■■□ 3.83
PKP3-211ENST00000534401 CUX2O14529 1486 aa38.94■■■■□ 3.82
PKP3-211ENST00000534401 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.93■■■■□ 3.82
PKP3-211ENST00000534401 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
PKP3-211ENST00000534401 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.72■■■■□ 3.79
PKP3-211ENST00000534401 PRDM2Q13029 1718 aa38.66■■■■□ 3.78
PKP3-211ENST00000534401 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.65■■■■□ 3.78
PKP3-211ENST00000534401 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.64■■■■□ 3.78
PKP3-211ENST00000534401 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.6■■■■□ 3.77
PKP3-211ENST00000534401 WDR62O43379 1518 aa38.56■■■■□ 3.76
PKP3-211ENST00000534401 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
PKP3-211ENST00000534401 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
PKP3-211ENST00000534401 ABCC8Q09428 1581 aa38.13■■■■□ 3.69
PKP3-211ENST00000534401 TOPBP1Q92547 1522 aa38.12■■■■□ 3.69
PKP3-211ENST00000534401 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.06■■■■□ 3.68
PKP3-211ENST00000534401 IFT140Q96RY7 1462 aa37.89■■■■□ 3.66
PKP3-211ENST00000534401 CUX1P39880 1505 aa37.8■■■■□ 3.64
PKP3-211ENST00000534401 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
PKP3-211ENST00000534401 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
PKP3-211ENST00000534401 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PKP3-211ENST00000534401 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.64■■■■□ 3.62
PKP3-211ENST00000534401 SOGA1O94964 1423 aa37.61■■■■□ 3.61
PKP3-211ENST00000534401 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.58■■■■□ 3.61
PKP3-211ENST00000534401 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PKP3-211ENST00000534401 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
PKP3-211ENST00000534401 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.592e-6■■■■■ 27.4
PKP3-211ENST00000534401 TOP2BQ02880 1626 aa37.47■■■■□ 3.59
PKP3-211ENST00000534401 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.47■■■■□ 3.59
PKP3-211ENST00000534401 WDR97A6NE52 1622 aa37.46■■■■□ 3.59
PKP3-211ENST00000534401 SYNJ1O43426 1573 aa37.41■■■■□ 3.58
PKP3-211ENST00000534401 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
PKP3-211ENST00000534401 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.35■■■■□ 3.57
PKP3-211ENST00000534401 OSCARQ8IYS5 282 aa37.27■■■■□ 3.56
PKP3-211ENST00000534401 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.19■■■■□ 3.54
PKP3-211ENST00000534401 GRIN2BQ13224 1484 aa37.19■■■■□ 3.54
PKP3-211ENST00000534401 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.17■■■■□ 3.54
PKP3-211ENST00000534401 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
PKP3-211ENST00000534401 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.1■■■■□ 3.53
PKP3-211ENST00000534401 CHD1O14646 1710 aa37.07■■■■□ 3.53
PKP3-211ENST00000534401 PBRM1Q86U86 1689 aa37.07■■■■□ 3.52
PKP3-211ENST00000534401 SYNJ2O15056 1496 aa36.96■■■■□ 3.51
PKP3-211ENST00000534401 FBLN2P98095 1184 aa36.9■■■■□ 3.5
PKP3-211ENST00000534401 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.89■■■■□ 3.5
PKP3-211ENST00000534401 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
PKP3-211ENST00000534401 TRIM41Q8WV44 630 aa36.84■■■■□ 3.49
PKP3-211ENST00000534401 ADAMTS12P58397 1594 aa36.8■■■■□ 3.48
PKP3-211ENST00000534401 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.76■■■■□ 3.47
PKP3-211ENST00000534401 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.75■■■■□ 3.47
PKP3-211ENST00000534401 GRIN2AQ12879 1464 aa36.7■■■■□ 3.47
PKP3-211ENST00000534401 KIF27Q86VH2 1401 aa36.7■■■■□ 3.47
PKP3-211ENST00000534401 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.68■■■■□ 3.46
PKP3-211ENST00000534401 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.68■■■■□ 3.46
PKP3-211ENST00000534401 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.68■■■■□ 3.46
PKP3-211ENST00000534401 ARHGEF11O15085 1522 aa36.67■■■■□ 3.46
PKP3-211ENST00000534401 IGF1RP08069 1367 aa36.65■■■■□ 3.46
PKP3-211ENST00000534401 NUP160Q12769 1436 aa36.6■■■■□ 3.45
PKP3-211ENST00000534401 CEP170Q5SW79 1584 aa36.53■■■■□ 3.44
PKP3-211ENST00000534401 CUL7Q14999 1698 aa36.49■■■■□ 3.43
PKP3-211ENST00000534401 ARAP1Q96P48 1450 aa36.38■■■■□ 3.41
PKP3-211ENST00000534401 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.37■■■■□ 3.41
PKP3-211ENST00000534401 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.37■■■■□ 3.41
PKP3-211ENST00000534401 SHROOM2Q13796 1616 aa36.35■■■■□ 3.41
PKP3-211ENST00000534401 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.26■■■■□ 3.4
PKP3-211ENST00000534401 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.21■■■■□ 3.39
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