RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464833.1

CHRD-211, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 5

Gene CHRD, Length 1,340 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-211ENST00000464833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.69■■■■■ 8.27
CHRD-211ENST00000464833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.16■■■■■ 7.06
CHRD-211ENST00000464833 ABCC9O60706 1549 aa57.48■■■■■ 6.79
CHRD-211ENST00000464833 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.64■■■■■ 6.5
CHRD-211ENST00000464833 NACADO15069 1562 aa55.51■■■■■ 6.48
CHRD-211ENST00000464833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.47■■■■■ 6.47
CHRD-211ENST00000464833 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.43■■■■■ 6.46
CHRD-211ENST00000464833 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.33■■■■■ 6.45
CHRD-211ENST00000464833 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.22■■■■■ 6.43
CHRD-211ENST00000464833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.3■■■■■ 6.28
CHRD-211ENST00000464833 SCRIBQ14160 1630 aa53.97■■■■■ 6.23
CHRD-211ENST00000464833 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.84■■■■■ 6.21
CHRD-211ENST00000464833 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.74■■■■■ 6.192e-9■■■■■ 30
CHRD-211ENST00000464833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.28■■■■■ 6.12
CHRD-211ENST00000464833 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.45■■■■■ 5.99
CHRD-211ENST00000464833 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.35■■■■■ 5.97
CHRD-211ENST00000464833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.05■■■■■ 5.92
CHRD-211ENST00000464833 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.91■■■■■ 5.9
CHRD-211ENST00000464833 SMARCA4P51532 1647 aa51.69■■■■■ 5.86
CHRD-211ENST00000464833 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.65■■■■■ 5.86
CHRD-211ENST00000464833 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.4■■■■■ 5.82
CHRD-211ENST00000464833 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.3■■■■■ 5.8
CHRD-211ENST00000464833 SMARCA2P51531 1590 aa51.24■■■■■ 5.79
CHRD-211ENST00000464833 NCAPD3P42695 1498 aa51.21■■■■■ 5.79
CHRD-211ENST00000464833 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.19■■■■■ 5.79
CHRD-211ENST00000464833 HMGXB3Q12766 1538 aa51.01■■■■■ 5.76
CHRD-211ENST00000464833 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.94■■■■■ 5.74
CHRD-211ENST00000464833 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.87■■■■■ 5.73
CHRD-211ENST00000464833 WIZO95785 1651 aa50.87■■■■■ 5.73
CHRD-211ENST00000464833 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.35■■■■■ 5.65
CHRD-211ENST00000464833 NESP48681 1621 aa49.87■■■■■ 5.57
CHRD-211ENST00000464833 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.81■■■■■ 5.56
CHRD-211ENST00000464833 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.81■■■■■ 5.56
CHRD-211ENST00000464833 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.74■■■■■ 5.55
CHRD-211ENST00000464833 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.72■■■■■ 5.55
CHRD-211ENST00000464833 CFTRP13569 1480 aa49.52■■■■■ 5.52
CHRD-211ENST00000464833 ERCC6Q03468 1493 aa49.48■■■■■ 5.51
CHRD-211ENST00000464833 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.42■■■■■ 5.5
CHRD-211ENST00000464833 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.32■■■■■ 5.49
CHRD-211ENST00000464833 PRDM2Q13029 1718 aa49.23■■■■■ 5.47
CHRD-211ENST00000464833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.15■■■■■ 5.46
CHRD-211ENST00000464833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.08■■■■■ 5.45
CHRD-211ENST00000464833 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.05■■■■■ 5.44
CHRD-211ENST00000464833 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.92■■■■■ 5.42
CHRD-211ENST00000464833 CUX2O14529 1486 aa48.88■■■■■ 5.42
CHRD-211ENST00000464833 WDR62O43379 1518 aa48.78■■■■■ 5.4
CHRD-211ENST00000464833 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
CHRD-211ENST00000464833 TOPBP1Q92547 1522 aa48.43■■■■■ 5.34
CHRD-211ENST00000464833 ABCC8Q09428 1581 aa48.41■■■■■ 5.34
CHRD-211ENST00000464833 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.41■■■■■ 5.34
CHRD-211ENST00000464833 CUX1P39880 1505 aa48.21■■■■■ 5.31
CHRD-211ENST00000464833 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
CHRD-211ENST00000464833 IFT140Q96RY7 1462 aa48.01■■■■■ 5.28
CHRD-211ENST00000464833 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.99■■■■■ 5.27
CHRD-211ENST00000464833 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.97■■■■■ 5.27
CHRD-211ENST00000464833 SYNJ1O43426 1573 aa47.9■■■■■ 5.26
CHRD-211ENST00000464833 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
CHRD-211ENST00000464833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.9■■■■■ 5.26
CHRD-211ENST00000464833 TOP2BQ02880 1626 aa47.89■■■■■ 5.26
CHRD-211ENST00000464833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.81■■■■■ 5.24
CHRD-211ENST00000464833 SOGA1O94964 1423 aa47.81■■■■■ 5.24
CHRD-211ENST00000464833 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
CHRD-211ENST00000464833 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.21
CHRD-211ENST00000464833 WDR97A6NE52 1622 aa47.61■■■■■ 5.21
CHRD-211ENST00000464833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.54■■■■■ 5.2
CHRD-211ENST00000464833 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.54■■■■■ 5.22e-11■■■■□ 23.9
CHRD-211ENST00000464833 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
CHRD-211ENST00000464833 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.34■■■■■ 5.17
CHRD-211ENST00000464833 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.28■■■■■ 5.16
CHRD-211ENST00000464833 GRIN2BQ13224 1484 aa47.23■■■■■ 5.15
CHRD-211ENST00000464833 PBRM1Q86U86 1689 aa47.2■■■■■ 5.15
CHRD-211ENST00000464833 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.11■■■■■ 5.13
CHRD-211ENST00000464833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
CHRD-211ENST00000464833 TRIM41Q8WV44 630 aa47.04■■■■■ 5.12
CHRD-211ENST00000464833 CHD1O14646 1710 aa46.97■■■■■ 5.11
CHRD-211ENST00000464833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
CHRD-211ENST00000464833 KIF27Q86VH2 1401 aa46.95■■■■■ 5.11
CHRD-211ENST00000464833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.94■■■■■ 5.1
CHRD-211ENST00000464833 SYNJ2O15056 1496 aa46.88■■■■■ 5.1
CHRD-211ENST00000464833 OSCARQ8IYS5 282 aa46.86■■■■■ 5.09
CHRD-211ENST00000464833 ADAMTS12P58397 1594 aa46.86■■■■■ 5.09
CHRD-211ENST00000464833 FBLN2P98095 1184 aa46.81■■■■■ 5.08
CHRD-211ENST00000464833 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
CHRD-211ENST00000464833 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.75■■■■■ 5.07
CHRD-211ENST00000464833 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.75■■■■■ 5.07
CHRD-211ENST00000464833 IGF1RP08069 1367 aa46.74■■■■■ 5.07
CHRD-211ENST00000464833 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.66■■■■■ 5.06
CHRD-211ENST00000464833 GRIN2AQ12879 1464 aa46.63■■■■■ 5.06
CHRD-211ENST00000464833 CUL7Q14999 1698 aa46.62■■■■■ 5.05
CHRD-211ENST00000464833 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.48■■■■■ 5.03
CHRD-211ENST00000464833 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.44■■■■■ 5.03
CHRD-211ENST00000464833 NUP160Q12769 1436 aa46.43■■■■■ 5.02
CHRD-211ENST00000464833 CEP170Q5SW79 1584 aa46.4■■■■■ 5.02
CHRD-211ENST00000464833 EEA1Q15075 1411 aa46.29■■■■■ 5
CHRD-211ENST00000464833 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.22■■■■■ 4.99
CHRD-211ENST00000464833 PRXQ9BXM0 1461 aa46.18■■■■■ 4.98
CHRD-211ENST00000464833 ARHGEF11O15085 1522 aa46.17■■■■■ 4.98
CHRD-211ENST00000464833 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.15■■■■■ 4.98
CHRD-211ENST00000464833 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.15■■■■■ 4.98
CHRD-211ENST00000464833 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.15■■■■■ 4.98
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