RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327397.8

PIEZO1-202, Transcript of piezo type mechanosensitive ion channel component 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PIEZO1, Length 1,246 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIEZO1-202ENST00000327397 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.09■■■■■ 4.97
PIEZO1-202ENST00000327397 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.18■■■■■ 4.18
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PIEZO1-202ENST00000327397 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.94■■■■□ 3.82
PIEZO1-202ENST00000327397 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.76■■■■□ 3.8
PIEZO1-202ENST00000327397 NACADO15069 1562 aa38.75■■■■□ 3.79
PIEZO1-202ENST00000327397 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
PIEZO1-202ENST00000327397 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.29■■■■□ 3.72
PIEZO1-202ENST00000327397 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.28■■■■□ 3.72
PIEZO1-202ENST00000327397 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.682e-6■■■□□ 18.8
PIEZO1-202ENST00000327397 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.01■■■■□ 3.67
PIEZO1-202ENST00000327397 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.88■■■■□ 3.65
PIEZO1-202ENST00000327397 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.85■■■■□ 3.65
PIEZO1-202ENST00000327397 SCRIBQ14160 1630 aa37.66■■■■□ 3.62
PIEZO1-202ENST00000327397 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.18■■■■□ 3.54
PIEZO1-202ENST00000327397 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.87■■■■□ 3.49
PIEZO1-202ENST00000327397 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
PIEZO1-202ENST00000327397 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.62■■■■□ 3.45
PIEZO1-202ENST00000327397 SMARCA4P51532 1647 aa35.91■■■■□ 3.34
PIEZO1-202ENST00000327397 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.76■■■■□ 3.32
PIEZO1-202ENST00000327397 NCAPD3P42695 1498 aa35.74■■■■□ 3.31
PIEZO1-202ENST00000327397 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PIEZO1-202ENST00000327397 SMARCA2P51531 1590 aa35.67■■■■□ 3.3
PIEZO1-202ENST00000327397 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.59■■■■□ 3.29
PIEZO1-202ENST00000327397 HMGXB3Q12766 1538 aa35.56■■■■□ 3.28
PIEZO1-202ENST00000327397 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.47■■■■□ 3.27
PIEZO1-202ENST00000327397 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
PIEZO1-202ENST00000327397 WIZO95785 1651 aa35.26■■■■□ 3.23
PIEZO1-202ENST00000327397 NESP48681 1621 aa35.21■■■■□ 3.23
PIEZO1-202ENST00000327397 ERCC6Q03468 1493 aa35.12■■■■□ 3.21
PIEZO1-202ENST00000327397 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
PIEZO1-202ENST00000327397 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.91■■■■□ 3.18
PIEZO1-202ENST00000327397 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.83■■■■□ 3.17
PIEZO1-202ENST00000327397 CUX2O14529 1486 aa34.82■■■■□ 3.16
PIEZO1-202ENST00000327397 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
PIEZO1-202ENST00000327397 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
PIEZO1-202ENST00000327397 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.69■■■■□ 3.14
PIEZO1-202ENST00000327397 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.64■■■■□ 3.14
PIEZO1-202ENST00000327397 CFTRP13569 1480 aa34.41■■■■□ 3.1
PIEZO1-202ENST00000327397 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.39■■■■□ 3.1
PIEZO1-202ENST00000327397 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.36■■■■□ 3.09
PIEZO1-202ENST00000327397 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.34■■■■□ 3.09
PIEZO1-202ENST00000327397 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.34■■■■□ 3.09
PIEZO1-202ENST00000327397 WDR62O43379 1518 aa34.3■■■■□ 3.08
PIEZO1-202ENST00000327397 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.29■■■■□ 3.08
PIEZO1-202ENST00000327397 PRDM2Q13029 1718 aa34.28■■■■□ 3.08
PIEZO1-202ENST00000327397 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
PIEZO1-202ENST00000327397 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PIEZO1-202ENST00000327397 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
PIEZO1-202ENST00000327397 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.69■■■□□ 2.98
PIEZO1-202ENST00000327397 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PIEZO1-202ENST00000327397 ABCC8Q09428 1581 aa33.6■■■□□ 2.97
PIEZO1-202ENST00000327397 IFT140Q96RY7 1462 aa33.6■■■□□ 2.97
PIEZO1-202ENST00000327397 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
PIEZO1-202ENST00000327397 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
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PIEZO1-202ENST00000327397 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.39■■■□□ 2.94
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PIEZO1-202ENST00000327397 SOGA1O94964 1423 aa33.28■■■□□ 2.92
PIEZO1-202ENST00000327397 CHD1O14646 1710 aa33.22■■■□□ 2.91
PIEZO1-202ENST00000327397 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
PIEZO1-202ENST00000327397 WDR97A6NE52 1622 aa33.15■■■□□ 2.9
PIEZO1-202ENST00000327397 TRIM41Q8WV44 630 aa33.1■■■□□ 2.89
PIEZO1-202ENST00000327397 SYNJ1O43426 1573 aa33.02■■■□□ 2.88
PIEZO1-202ENST00000327397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.02■■■□□ 2.88
PIEZO1-202ENST00000327397 FBLN2P98095 1184 aa33.02■■■□□ 2.88
PIEZO1-202ENST00000327397 PBRM1Q86U86 1689 aa33■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.99■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.96■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 TOP2BQ02880 1626 aa32.96■■■□□ 2.87
PIEZO1-202ENST00000327397 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.93■■■□□ 2.86
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PIEZO1-202ENST00000327397 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.91■■■□□ 2.86
PIEZO1-202ENST00000327397 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.9■■■□□ 2.86
PIEZO1-202ENST00000327397 ARHGEF11O15085 1522 aa32.87■■■□□ 2.85
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PIEZO1-202ENST00000327397 ARAP1Q96P48 1450 aa32.6■■■□□ 2.81
PIEZO1-202ENST00000327397 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.58■■■□□ 2.81
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PIEZO1-202ENST00000327397 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.51■■■□□ 2.79
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PIEZO1-202ENST00000327397 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.46■■■□□ 2.79
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PIEZO1-202ENST00000327397 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.35■■■□□ 2.77
PIEZO1-202ENST00000327397 KIF27Q86VH2 1401 aa32.26■■■□□ 2.76
PIEZO1-202ENST00000327397 SHROOM2Q13796 1616 aa32.25■■■□□ 2.75
PIEZO1-202ENST00000327397 IGF1RP08069 1367 aa32.21■■■□□ 2.75
PIEZO1-202ENST00000327397 CUL7Q14999 1698 aa32.18■■■□□ 2.74
PIEZO1-202ENST00000327397 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.16■■■□□ 2.74
PIEZO1-202ENST00000327397 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
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