RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483342.5

SNHG11-215, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG11, Length 1,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-215ENST00000483342 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.76■■■■□ 3.96
SNHG11-215ENST00000483342 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.96■■■■□ 3.19
SNHG11-215ENST00000483342 ABCC9O60706 1549 aa33.86■■■■□ 3.01
SNHG11-215ENST00000483342 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.26■■■□□ 2.91
SNHG11-215ENST00000483342 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
SNHG11-215ENST00000483342 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.87■■■□□ 2.85
SNHG11-215ENST00000483342 NACADO15069 1562 aa32.82■■■□□ 2.84
SNHG11-215ENST00000483342 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.78■■■□□ 2.84
SNHG11-215ENST00000483342 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.71■■■□□ 2.83
SNHG11-215ENST00000483342 SCRIBQ14160 1630 aa32.06■■■□□ 2.72
SNHG11-215ENST00000483342 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.95■■■□□ 2.71
SNHG11-215ENST00000483342 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.85■■■□□ 2.69
SNHG11-215ENST00000483342 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
SNHG11-215ENST00000483342 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.65■■■□□ 2.66
SNHG11-215ENST00000483342 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.98■■■□□ 2.55
SNHG11-215ENST00000483342 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.95■■■□□ 2.54
SNHG11-215ENST00000483342 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
SNHG11-215ENST00000483342 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
SNHG11-215ENST00000483342 SMARCA4P51532 1647 aa30.68■■■□□ 2.5
SNHG11-215ENST00000483342 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.67■■■□□ 2.5
SNHG11-215ENST00000483342 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.6■■■□□ 2.49
SNHG11-215ENST00000483342 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
SNHG11-215ENST00000483342 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SNHG11-215ENST00000483342 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.43■■■□□ 2.46
SNHG11-215ENST00000483342 SMARCA2P51531 1590 aa30.39■■■□□ 2.46
SNHG11-215ENST00000483342 WIZO95785 1651 aa30.34■■■□□ 2.45
SNHG11-215ENST00000483342 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.33■■■□□ 2.45
SNHG11-215ENST00000483342 NCAPD3P42695 1498 aa30.32■■■□□ 2.44
SNHG11-215ENST00000483342 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
SNHG11-215ENST00000483342 HMGXB3Q12766 1538 aa30.15■■■□□ 2.42
SNHG11-215ENST00000483342 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SNHG11-215ENST00000483342 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.76■■■□□ 2.35
SNHG11-215ENST00000483342 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.51■■■□□ 2.32
SNHG11-215ENST00000483342 NESP48681 1621 aa29.41■■■□□ 2.3
SNHG11-215ENST00000483342 CFTRP13569 1480 aa29.41■■■□□ 2.3
SNHG11-215ENST00000483342 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.37■■■□□ 2.29
SNHG11-215ENST00000483342 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.25■■■□□ 2.27
SNHG11-215ENST00000483342 ERCC6Q03468 1493 aa29.2■■■□□ 2.26
SNHG11-215ENST00000483342 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.15■■■□□ 2.26
SNHG11-215ENST00000483342 PRDM2Q13029 1718 aa29.07■■■□□ 2.24
SNHG11-215ENST00000483342 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.04■■■□□ 2.24
SNHG11-215ENST00000483342 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.98■■■□□ 2.23
SNHG11-215ENST00000483342 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.86■■■□□ 2.21
SNHG11-215ENST00000483342 ABCC8Q09428 1581 aa28.83■■■□□ 2.21
SNHG11-215ENST00000483342 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
SNHG11-215ENST00000483342 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SNHG11-215ENST00000483342 CUX2O14529 1486 aa28.81■■■□□ 2.2
SNHG11-215ENST00000483342 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
SNHG11-215ENST00000483342 CUX1P39880 1505 aa28.72■■■□□ 2.19
SNHG11-215ENST00000483342 TOPBP1Q92547 1522 aa28.72■■■□□ 2.19
SNHG11-215ENST00000483342 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.71■■■□□ 2.19
SNHG11-215ENST00000483342 TRIM41Q8WV44 630 aa28.71■■■□□ 2.19
SNHG11-215ENST00000483342 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.7■■■□□ 2.19
SNHG11-215ENST00000483342 WDR62O43379 1518 aa28.69■■■□□ 2.18
SNHG11-215ENST00000483342 SYNJ1O43426 1573 aa28.64■■■□□ 2.17
SNHG11-215ENST00000483342 TOP2BQ02880 1626 aa28.61■■■□□ 2.17
SNHG11-215ENST00000483342 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.56■■■□□ 2.16
SNHG11-215ENST00000483342 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.55■■■□□ 2.16
SNHG11-215ENST00000483342 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
SNHG11-215ENST00000483342 SOGA1O94964 1423 aa28.5■■■□□ 2.15
SNHG11-215ENST00000483342 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.44■■■□□ 2.14
SNHG11-215ENST00000483342 IFT140Q96RY7 1462 aa28.41■■■□□ 2.14
SNHG11-215ENST00000483342 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SNHG11-215ENST00000483342 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.29■■■□□ 2.12
SNHG11-215ENST00000483342 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SNHG11-215ENST00000483342 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SNHG11-215ENST00000483342 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.11e-6■■■■■ 33.8
SNHG11-215ENST00000483342 KIF27Q86VH2 1401 aa28.19■■■□□ 2.1
SNHG11-215ENST00000483342 WDR97A6NE52 1622 aa28.14■■■□□ 2.09
SNHG11-215ENST00000483342 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.13■■■□□ 2.09
SNHG11-215ENST00000483342 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SNHG11-215ENST00000483342 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.11■■■□□ 2.09
SNHG11-215ENST00000483342 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SNHG11-215ENST00000483342 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.04■■■□□ 2.08
SNHG11-215ENST00000483342 GRIN2BQ13224 1484 aa28.04■■■□□ 2.08
SNHG11-215ENST00000483342 EEA1Q15075 1411 aa28.04■■■□□ 2.08
SNHG11-215ENST00000483342 IGF1RP08069 1367 aa28.03■■■□□ 2.08
SNHG11-215ENST00000483342 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.02■■■□□ 2.08
SNHG11-215ENST00000483342 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.95■■■□□ 2.07
SNHG11-215ENST00000483342 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.9■■■□□ 2.06
SNHG11-215ENST00000483342 PBRM1Q86U86 1689 aa27.9■■■□□ 2.06
SNHG11-215ENST00000483342 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.88■■■□□ 2.05
SNHG11-215ENST00000483342 FBLN2P98095 1184 aa27.87■■■□□ 2.05
SNHG11-215ENST00000483342 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SNHG11-215ENST00000483342 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SNHG11-215ENST00000483342 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.85■■■□□ 2.05
SNHG11-215ENST00000483342 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
SNHG11-215ENST00000483342 CUL7Q14999 1698 aa27.77■■■□□ 2.04
SNHG11-215ENST00000483342 SYNJ2O15056 1496 aa27.77■■■□□ 2.04
SNHG11-215ENST00000483342 PRXQ9BXM0 1461 aa27.76■■■□□ 2.03
SNHG11-215ENST00000483342 ADAMTS12P58397 1594 aa27.75■■■□□ 2.03
SNHG11-215ENST00000483342 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.75■■■□□ 2.03
SNHG11-215ENST00000483342 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.74■■■□□ 2.03
SNHG11-215ENST00000483342 GRIN2AQ12879 1464 aa27.66■■■□□ 2.02
SNHG11-215ENST00000483342 OSCARQ8IYS5 282 aa27.66■■■□□ 2.02
SNHG11-215ENST00000483342 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
SNHG11-215ENST00000483342 KIF21BO75037 1637 aa27.61■■■□□ 2.01
SNHG11-215ENST00000483342 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.6■■■□□ 2.01
SNHG11-215ENST00000483342 GOLGA3Q08378 1498 aa27.59■■■□□ 2.01
SNHG11-215ENST00000483342 CHD1O14646 1710 aa27.57■■■□□ 2
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