Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 59.53□□□□□ -0.882e-36■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.27□□□□□ -1.252e-36■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 23.41□□□□□ -1.862e-36■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 23.14□□□□□ -1.912e-36■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.054e-15■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.54e-15■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-15■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.413e-36■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.513e-36■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.085e-6■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 NUP85-215ENST00000580879 583 ntTSL 313.37□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 NUP85-203ENST00000540768 1926 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 NUP85-218ENST00000582681 595 ntTSL 27.85□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 28
RBM22Q9NW64 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 216.38■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-204ENST00000366362 775 ntTSL 311.55□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-206ENST00000536066 2518 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-205ENST00000535350 618 ntTSL 37.41□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 SFT2D1-205ENST00000488773 546 ntTSL 55.6□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 215.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 311.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 WDR26-202ENST00000443112 1306 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 WDR26-209ENST00000489825 751 ntTSL 52.98□□□□□ -1.933e-7■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 CMIP-212ENST00000623842 2685 nt15.46■□□□□ 0.077e-16■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 CMIP-210ENST00000569146 1589 ntTSL 514.68□□□□□ -0.067e-16■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 CMIP-207ENST00000565680 556 ntTSL 413.93□□□□□ -0.187e-16■■■■■ 27.9
RBM22Q9NW64 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 WDR26-204ENST00000477425 529 ntTSL 34.4□□□□□ -1.713e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 WDR26-206ENST00000479778 2552 ntTSL 24.23□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.192e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 216.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-215ENST00000467585 570 ntTSL 213.07□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-208ENST00000445596 600 ntTSL 212.22□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-227ENST00000498746 579 ntTSL 210.44□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-211ENST00000465222 676 ntTSL 26.5□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-210ENST00000465032 578 ntTSL 25.9□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-212ENST00000465267 1054 ntTSL 25.9□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-221ENST00000491473 579 ntTSL 25.74□□□□□ -1.493e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 EIF4A2-220ENST00000486805 590 ntTSL 23.07□□□□□ -1.923e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-222ENST00000642141 921 nt10.3□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-207ENST00000507401 711 ntTSL 37.99□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-213ENST00000636759 3606 ntTSL 56.38□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-212ENST00000636194 8508 ntTSL 55.97□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-216ENST00000637968 4614 ntTSL 55.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.59□□□□□ -1.671e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-221ENST00000641996 12903 nt2.96□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.76□□□□□ -1.971e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 PRPSAP1-204ENST00000436498 1003 ntTSL 319.83■□□□□ 0.776e-11■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-213ENST00000482853 1245 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 CA8-202ENST00000524872 1825 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 GPI-210ENST00000589504 536 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 GPI-216ENST00000592144 678 ntTSL 318.28■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 GPI-209ENST00000589399 565 ntTSL 517.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 GPI-217ENST00000592277 615 ntTSL 417.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 GPI-211ENST00000589640 571 ntTSL 417.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 GPI-214ENST00000590375 529 ntTSL 417.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 RWDD3-205ENST00000492639 549 ntTSL 316.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 ATXN2L-214ENST00000564284 603 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 ATXN2L-226ENST00000570284 701 ntTSL 515.81■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 CA8-204ENST00000529918 1697 ntTSL 214.77□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.055e-12■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-205ENST00000465893 1456 ntTSL 1 (best)14.52□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 27.8
RBM22Q9NW64 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 27.8
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