Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 SLC26A6-219ENST00000485361 575 ntTSL 414.48□□□□□ -0.099e-17■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 IPO4-215ENST00000560935 701 ntTSL 318.92■□□□□ 0.625e-12■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 KRT19-207ENST00000593096 728 ntTSL 314.82□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 PLK1-208ENST00000568568 582 ntTSL 314.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 PLK1-207ENST00000567897 711 ntTSL 313.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.812e-36■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 219.64■□□□□ 0.732e-36■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 518.81■□□□□ 0.62e-36■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 415.08■□□□□ 02e-36■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 310.32□□□□□ -0.762e-36■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 519.93■□□□□ 0.783e-8■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 218.63■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 DVL2-211ENST00000576285 701 ntTSL 29.32□□□□□ -0.929e-12■■■■■ 41.3
EFTUD2Q15029 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.591e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-217ENST00000484181 1683 ntTSL 317.01■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-212ENST00000474833 921 ntTSL 513.55□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PCCB-213ENST00000475214 1295 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RPLP0-215ENST00000549242 518 ntTSL 212.28□□□□□ -0.445e-18■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RPLP0-212ENST00000548551 543 ntTSL 29.49□□□□□ -0.895e-18■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 FKBP11-211ENST00000551807 508 ntTSL 326.12■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 PSD4-212ENST00000493329 606 ntTSL 311.82□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-206ENST00000587119 2177 ntTSL 216.5■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-209ENST00000588731 2282 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 59.71□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 ATP13A1-204ENST00000467160 2431 ntTSL 218.9■□□□□ 0.621e-10■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.18e-9■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.258e-9■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -18e-9■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RNF214-203ENST00000529869 1570 ntTSL 58.74□□□□□ -1.018e-9■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.078e-9■■■■■ 41.2
EFTUD2Q15029 MSH5-209ENST00000450148 1000 ntTSL 511.59□□□□□ -0.552e-16■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 MSH5-212ENST00000467319 688 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-16■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 MSH5-213ENST00000468136 690 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-16■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 JTB-206ENST00000471173 754 ntTSL 320.52■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 JTB-205ENST00000461365 542 ntTSL 514.18□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 JTB-204ENST00000428469 520 ntTSL 39.19□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-14■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)17.09■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 SMARCAD1-204ENST00000457823 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 56.68□□□□□ -1.341e-14■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 SMARCAD1-203ENST00000394961 3778 ntTSL 25.8□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.093e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 SMARCAD1-202ENST00000359052 5017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best)1.7□□□□□ -2.143e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 INTS1-208ENST00000496988 421 ntTSL 37.61□□□□□ -1.196e-9■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 217.91■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 410.54□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 49.81□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 C7orf43-204ENST00000419841 1500 ntTSL 215.89■□□□□ 0.135e-10■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 ALG1-206ENST00000591822 1689 ntTSL 1 (best)23.67■■□□□ 1.383e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 MFN1-202ENST00000357390 3148 ntTSL 26.87□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 USP34-211ENST00000472706 556 ntTSL 45.17□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 USP34-205ENST00000453734 2708 ntTSL 1 (best)2.48□□□□□ -2.013e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 NAALADL1-209ENST00000528977 2385 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 NAALADL1-210ENST00000529274 2427 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 SSBP3-206ENST00000420121 593 ntTSL 310.35□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 41.1
EFTUD2Q15029 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)29.18■■■□□ 2.265e-10■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 221.22■□□□□ 0.995e-10■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 DNMT3A-213ENST00000484184 619 ntTSL 311.83□□□□□ -0.528e-14■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 MAP4K5-208ENST00000557210 1084 ntTSL 511.26□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 GPAA1-216ENST00000531593 543 ntTSL 315.46■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 PCBP4-216ENST00000497390 2434 ntTSL 217.29■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 41
EFTUD2Q15029 PCBP4-218ENST00000498822 2547 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-8■■■■■ 41
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