RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271843.8

JTB-201, Transcript of jumping translocation breakpoint, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene JTB, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JTB-201ENST00000271843 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.76■■■■□ 3.96
JTB-201ENST00000271843 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.47■■■■□ 3.27
JTB-201ENST00000271843 ABCC9O60706 1549 aa35.02■■■■□ 3.2
JTB-201ENST00000271843 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.51■■■□□ 2.96
JTB-201ENST00000271843 NACADO15069 1562 aa33.41■■■□□ 2.94
JTB-201ENST00000271843 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.25■■■□□ 2.91
JTB-201ENST00000271843 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.12■■■□□ 2.89
JTB-201ENST00000271843 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
JTB-201ENST00000271843 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.99■■■□□ 2.87
JTB-201ENST00000271843 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.87■■■□□ 2.85
JTB-201ENST00000271843 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.85■■■□□ 2.85
JTB-201ENST00000271843 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.67■■■□□ 2.82
JTB-201ENST00000271843 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.62■■■□□ 2.81
JTB-201ENST00000271843 SCRIBQ14160 1630 aa32.36■■■□□ 2.77
JTB-201ENST00000271843 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.13■■■□□ 2.73
JTB-201ENST00000271843 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
JTB-201ENST00000271843 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.68■■■□□ 2.66
JTB-201ENST00000271843 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.49■■■□□ 2.63
JTB-201ENST00000271843 SMARCA4P51532 1647 aa30.92■■■□□ 2.54
JTB-201ENST00000271843 NCAPD3P42695 1498 aa30.86■■■□□ 2.53
JTB-201ENST00000271843 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.83■■■□□ 2.53
JTB-201ENST00000271843 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
JTB-201ENST00000271843 SMARCA2P51531 1590 aa30.74■■■□□ 2.51
JTB-201ENST00000271843 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.66■■■□□ 2.5
JTB-201ENST00000271843 HMGXB3Q12766 1538 aa30.66■■■□□ 2.5
JTB-201ENST00000271843 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.64■■■□□ 2.5
JTB-201ENST00000271843 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
JTB-201ENST00000271843 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.4■■■□□ 2.46
JTB-201ENST00000271843 WIZO95785 1651 aa30.32■■■□□ 2.44
JTB-201ENST00000271843 NESP48681 1621 aa30.25■■■□□ 2.43
JTB-201ENST00000271843 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
JTB-201ENST00000271843 ERCC6Q03468 1493 aa30.14■■■□□ 2.42
JTB-201ENST00000271843 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.07■■■□□ 2.4
JTB-201ENST00000271843 CUX2O14529 1486 aa29.99■■■□□ 2.39
JTB-201ENST00000271843 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
JTB-201ENST00000271843 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.91■■■□□ 2.38
JTB-201ENST00000271843 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.88■■■□□ 2.37
JTB-201ENST00000271843 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
JTB-201ENST00000271843 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.84■■■□□ 2.37
JTB-201ENST00000271843 CFTRP13569 1480 aa29.7■■■□□ 2.35
JTB-201ENST00000271843 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.61■■■□□ 2.33
JTB-201ENST00000271843 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.6■■■□□ 2.33
JTB-201ENST00000271843 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.58■■■□□ 2.33
JTB-201ENST00000271843 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.55■■■□□ 2.32
JTB-201ENST00000271843 WDR62O43379 1518 aa29.54■■■□□ 2.32
JTB-201ENST00000271843 PRDM2Q13029 1718 aa29.45■■■□□ 2.3
JTB-201ENST00000271843 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
JTB-201ENST00000271843 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
JTB-201ENST00000271843 TOPBP1Q92547 1522 aa29.09■■■□□ 2.25
JTB-201ENST00000271843 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.01■■■□□ 2.24
JTB-201ENST00000271843 ABCC8Q09428 1581 aa29■■■□□ 2.23
JTB-201ENST00000271843 IFT140Q96RY7 1462 aa28.95■■■□□ 2.22
JTB-201ENST00000271843 TRIM41Q8WV44 630 aa28.92■■■□□ 2.22
JTB-201ENST00000271843 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
JTB-201ENST00000271843 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
JTB-201ENST00000271843 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
JTB-201ENST00000271843 CUX1P39880 1505 aa28.78■■■□□ 2.2
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JTB-201ENST00000271843 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.72■■■□□ 2.19
JTB-201ENST00000271843 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.71■■■□□ 2.19
JTB-201ENST00000271843 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.182e-8■■■■■ 35
JTB-201ENST00000271843 SOGA1O94964 1423 aa28.67■■■□□ 2.18
JTB-201ENST00000271843 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
JTB-201ENST00000271843 WDR97A6NE52 1622 aa28.52■■■□□ 2.16
JTB-201ENST00000271843 CHD1O14646 1710 aa28.47■■■□□ 2.15
JTB-201ENST00000271843 SYNJ1O43426 1573 aa28.43■■■□□ 2.14
JTB-201ENST00000271843 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.43■■■□□ 2.14
JTB-201ENST00000271843 TOP2BQ02880 1626 aa28.42■■■□□ 2.14
JTB-201ENST00000271843 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.148e-7■■□□□ 13.9
JTB-201ENST00000271843 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.4■■■□□ 2.14
JTB-201ENST00000271843 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.4■■■□□ 2.14
JTB-201ENST00000271843 GRIN2BQ13224 1484 aa28.37■■■□□ 2.13
JTB-201ENST00000271843 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.36■■■□□ 2.13
JTB-201ENST00000271843 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.34■■■□□ 2.13
JTB-201ENST00000271843 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
JTB-201ENST00000271843 PBRM1Q86U86 1689 aa28.32■■■□□ 2.12
JTB-201ENST00000271843 FBLN2P98095 1184 aa28.32■■■□□ 2.12
JTB-201ENST00000271843 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.3■■■□□ 2.12
JTB-201ENST00000271843 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.3■■■□□ 2.12
JTB-201ENST00000271843 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.3■■■□□ 2.12
JTB-201ENST00000271843 ARHGEF11O15085 1522 aa28.24■■■□□ 2.11
JTB-201ENST00000271843 SYNJ2O15056 1496 aa28.23■■■□□ 2.11
JTB-201ENST00000271843 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
JTB-201ENST00000271843 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.17■■■□□ 2.1
JTB-201ENST00000271843 ADAMTS12P58397 1594 aa28.09■■■□□ 2.09
JTB-201ENST00000271843 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.08■■■□□ 2.09
JTB-201ENST00000271843 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.04■■■□□ 2.08
JTB-201ENST00000271843 GRIN2AQ12879 1464 aa28.02■■■□□ 2.08
JTB-201ENST00000271843 ARAP1Q96P48 1450 aa28.02■■■□□ 2.08
JTB-201ENST00000271843 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.99■■■□□ 2.07
JTB-201ENST00000271843 CEP170Q5SW79 1584 aa27.94■■■□□ 2.06
JTB-201ENST00000271843 NUP160Q12769 1436 aa27.92■■■□□ 2.06
JTB-201ENST00000271843 KIF27Q86VH2 1401 aa27.83■■■□□ 2.05
JTB-201ENST00000271843 IGF1RP08069 1367 aa27.81■■■□□ 2.04
JTB-201ENST00000271843 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
JTB-201ENST00000271843 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.79■■■□□ 2.04
JTB-201ENST00000271843 SHROOM2Q13796 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
JTB-201ENST00000271843 CUL7Q14999 1698 aa27.72■■■□□ 2.03
JTB-201ENST00000271843 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.69■■■□□ 2.02
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