RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356648.5

JTB-202, Transcript of jumping translocation breakpoint, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene JTB, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JTB-202ENST00000356648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.32■■■■□ 3.08
JTB-202ENST00000356648 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.34■■■□□ 2.45
JTB-202ENST00000356648 ABCC9O60706 1549 aa29.11■■■□□ 2.25
JTB-202ENST00000356648 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
JTB-202ENST00000356648 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.47■■■□□ 2.15
JTB-202ENST00000356648 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.42■■■□□ 2.14
JTB-202ENST00000356648 NACADO15069 1562 aa28.37■■■□□ 2.13
JTB-202ENST00000356648 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.26■■■□□ 2.11
JTB-202ENST00000356648 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.24■■■□□ 2.11
JTB-202ENST00000356648 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.72■■■□□ 2.03
JTB-202ENST00000356648 SCRIBQ14160 1630 aa27.66■■■□□ 2.02
JTB-202ENST00000356648 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.46■■□□□ 1.99
JTB-202ENST00000356648 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.27■■□□□ 1.96
JTB-202ENST00000356648 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
JTB-202ENST00000356648 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.67■■□□□ 1.86
JTB-202ENST00000356648 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
JTB-202ENST00000356648 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
JTB-202ENST00000356648 SMARCA4P51532 1647 aa26.54■■□□□ 1.84
JTB-202ENST00000356648 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.46■■□□□ 1.83
JTB-202ENST00000356648 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.4■■□□□ 1.82
JTB-202ENST00000356648 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.32■■□□□ 1.8
JTB-202ENST00000356648 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
JTB-202ENST00000356648 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.29■■□□□ 1.8
JTB-202ENST00000356648 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.24■■□□□ 1.79
JTB-202ENST00000356648 SMARCA2P51531 1590 aa26.24■■□□□ 1.79
JTB-202ENST00000356648 WIZO95785 1651 aa26.19■■□□□ 1.78
JTB-202ENST00000356648 NCAPD3P42695 1498 aa26.17■■□□□ 1.78
JTB-202ENST00000356648 HMGXB3Q12766 1538 aa26.11■■□□□ 1.77
JTB-202ENST00000356648 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
JTB-202ENST00000356648 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
JTB-202ENST00000356648 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
JTB-202ENST00000356648 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.61■■□□□ 1.69
JTB-202ENST00000356648 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.4■■□□□ 1.66
JTB-202ENST00000356648 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.4■■□□□ 1.66
JTB-202ENST00000356648 CFTRP13569 1480 aa25.38■■□□□ 1.65
JTB-202ENST00000356648 NESP48681 1621 aa25.37■■□□□ 1.65
JTB-202ENST00000356648 PRDM2Q13029 1718 aa25.3■■□□□ 1.64
JTB-202ENST00000356648 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.16■■□□□ 1.62
JTB-202ENST00000356648 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.13■■□□□ 1.61
JTB-202ENST00000356648 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.1■■□□□ 1.61
JTB-202ENST00000356648 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.02■■□□□ 1.6
JTB-202ENST00000356648 ERCC6Q03468 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
JTB-202ENST00000356648 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
JTB-202ENST00000356648 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.91■■□□□ 1.58
JTB-202ENST00000356648 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
JTB-202ENST00000356648 WDR62O43379 1518 aa24.85■■□□□ 1.57
JTB-202ENST00000356648 ABCC8Q09428 1581 aa24.83■■□□□ 1.57
JTB-202ENST00000356648 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.81■■□□□ 1.56
JTB-202ENST00000356648 CUX1P39880 1505 aa24.79■■□□□ 1.56
JTB-202ENST00000356648 TOPBP1Q92547 1522 aa24.78■■□□□ 1.56
JTB-202ENST00000356648 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.568e-7■■□□□ 13.9
JTB-202ENST00000356648 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.74■■□□□ 1.55
JTB-202ENST00000356648 SYNJ1O43426 1573 aa24.73■■□□□ 1.55
JTB-202ENST00000356648 TOP2BQ02880 1626 aa24.72■■□□□ 1.55
JTB-202ENST00000356648 CUX2O14529 1486 aa24.66■■□□□ 1.54
JTB-202ENST00000356648 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
JTB-202ENST00000356648 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.61■■□□□ 1.53
JTB-202ENST00000356648 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
JTB-202ENST00000356648 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.51■■□□□ 1.51
JTB-202ENST00000356648 IFT140Q96RY7 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
JTB-202ENST00000356648 WDR97A6NE52 1622 aa24.46■■□□□ 1.51
JTB-202ENST00000356648 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.46■■□□□ 1.51
JTB-202ENST00000356648 SOGA1O94964 1423 aa24.46■■□□□ 1.51
JTB-202ENST00000356648 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.42■■□□□ 1.5
JTB-202ENST00000356648 TRIM41Q8WV44 630 aa24.41■■□□□ 1.5
JTB-202ENST00000356648 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
JTB-202ENST00000356648 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.31■■□□□ 1.48
JTB-202ENST00000356648 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
JTB-202ENST00000356648 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
JTB-202ENST00000356648 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.472e-8■■■■■ 35
JTB-202ENST00000356648 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.2■■□□□ 1.47
JTB-202ENST00000356648 KIF27Q86VH2 1401 aa24.19■■□□□ 1.46
JTB-202ENST00000356648 PBRM1Q86U86 1689 aa24.19■■□□□ 1.46
JTB-202ENST00000356648 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
JTB-202ENST00000356648 GRIN2BQ13224 1484 aa24.15■■□□□ 1.46
JTB-202ENST00000356648 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.13■■□□□ 1.45
JTB-202ENST00000356648 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.1■■□□□ 1.45
JTB-202ENST00000356648 EEA1Q15075 1411 aa24.09■■□□□ 1.45
JTB-202ENST00000356648 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.06■■□□□ 1.44
JTB-202ENST00000356648 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
JTB-202ENST00000356648 IGF1RP08069 1367 aa24.05■■□□□ 1.44
JTB-202ENST00000356648 ADAMTS12P58397 1594 aa24.03■■□□□ 1.44
JTB-202ENST00000356648 CUL7Q14999 1698 aa24.02■■□□□ 1.44
JTB-202ENST00000356648 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.96■■□□□ 1.43
JTB-202ENST00000356648 SYNJ2O15056 1496 aa23.94■■□□□ 1.42
JTB-202ENST00000356648 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.92■■□□□ 1.42
JTB-202ENST00000356648 PRXQ9BXM0 1461 aa23.92■■□□□ 1.42
JTB-202ENST00000356648 CHD1O14646 1710 aa23.91■■□□□ 1.42
JTB-202ENST00000356648 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.91■■□□□ 1.42
JTB-202ENST00000356648 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
JTB-202ENST00000356648 GRIN2AQ12879 1464 aa23.85■■□□□ 1.41
JTB-202ENST00000356648 KIF21BO75037 1637 aa23.84■■□□□ 1.41
JTB-202ENST00000356648 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.83■■□□□ 1.41
JTB-202ENST00000356648 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
JTB-202ENST00000356648 NUP160Q12769 1436 aa23.76■■□□□ 1.39
JTB-202ENST00000356648 CEP170Q5SW79 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
JTB-202ENST00000356648 FBLN2P98095 1184 aa23.73■■□□□ 1.39
JTB-202ENST00000356648 GOLGA3Q08378 1498 aa23.68■■□□□ 1.38
JTB-202ENST00000356648 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.68■■□□□ 1.38
JTB-202ENST00000356648 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.64■■□□□ 1.38
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