Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSPAN16Q9UKR8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSPAN16Q9UKR8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSPAN16Q9UKR8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TSPAN16Q9UKR8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSPAN16Q9UKR8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TSPAN16Q9UKR8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSPAN16Q9UKR8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms