Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TSPAN16Q9UKR8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TSPAN16Q9UKR8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
TSPAN16Q9UKR8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TSPAN16Q9UKR8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TSPAN16Q9UKR8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TSPAN16Q9UKR8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TSPAN16Q9UKR8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TSPAN16Q9UKR8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TSPAN16Q9UKR8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TSPAN16Q9UKR8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TSPAN16Q9UKR8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TSPAN16Q9UKR8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TSPAN16Q9UKR8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TSPAN16Q9UKR8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TSPAN16Q9UKR8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TSPAN16Q9UKR8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TSPAN16Q9UKR8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TSPAN16Q9UKR8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TSPAN16Q9UKR8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TSPAN16Q9UKR8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TSPAN16Q9UKR8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TSPAN16Q9UKR8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TSPAN16Q9UKR8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TSPAN16Q9UKR8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TSPAN16Q9UKR8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TSPAN16Q9UKR8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TSPAN16Q9UKR8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSPAN16Q9UKR8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TSPAN16Q9UKR8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TSPAN16Q9UKR8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSPAN16Q9UKR8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TSPAN16Q9UKR8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSPAN16Q9UKR8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TSPAN16Q9UKR8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TSPAN16Q9UKR8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSPAN16Q9UKR8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TSPAN16Q9UKR8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TSPAN16Q9UKR8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TSPAN16Q9UKR8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TSPAN16Q9UKR8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TSPAN16Q9UKR8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TSPAN16Q9UKR8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TSPAN16Q9UKR8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TSPAN16Q9UKR8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TSPAN16Q9UKR8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TSPAN16Q9UKR8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TSPAN16Q9UKR8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TSPAN16Q9UKR8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TSPAN16Q9UKR8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TSPAN16Q9UKR8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TSPAN16Q9UKR8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TSPAN16Q9UKR8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TSPAN16Q9UKR8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSPAN16Q9UKR8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TSPAN16Q9UKR8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSPAN16Q9UKR8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TSPAN16Q9UKR8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TSPAN16Q9UKR8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TSPAN16Q9UKR8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TSPAN16Q9UKR8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TSPAN16Q9UKR8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TSPAN16Q9UKR8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSPAN16Q9UKR8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TSPAN16Q9UKR8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSPAN16Q9UKR8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSPAN16Q9UKR8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TSPAN16Q9UKR8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TSPAN16Q9UKR8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TSPAN16Q9UKR8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TSPAN16Q9UKR8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TSPAN16Q9UKR8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TSPAN16Q9UKR8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TSPAN16Q9UKR8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TSPAN16Q9UKR8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TSPAN16Q9UKR8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TSPAN16Q9UKR8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
TSPAN16Q9UKR8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TSPAN16Q9UKR8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TSPAN16Q9UKR8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TSPAN16Q9UKR8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms