Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HAPLN3Q96S86 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HAPLN3Q96S86 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HAPLN3Q96S86 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HAPLN3Q96S86 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HAPLN3Q96S86 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HAPLN3Q96S86 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HAPLN3Q96S86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms