Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCORQ96JN0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LCORQ96JN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LCORQ96JN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCORQ96JN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCORQ96JN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCORQ96JN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCORQ96JN0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCORQ96JN0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LCORQ96JN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LCORQ96JN0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms