Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMPDL3AQ92484 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPDL3AQ92484 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3AQ92484 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPDL3AQ92484 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPDL3AQ92484 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1348.4 ms