Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EBI3Q14213 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EBI3Q14213 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBI3Q14213 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBI3Q14213 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms