Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CRIP2P52943 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CRIP2P52943 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRIP2P52943 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CRIP2P52943 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRIP2P52943 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP2P52943 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP2P52943 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP2P52943 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP2P52943 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP2P52943 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRIP2P52943 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms