Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.555e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CMC2-207ENST00000564174 424 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.585e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 DMWD-205ENST00000598237 643 ntTSL 1 (best)44.28■■■■■ 4.686e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 DMWD-206ENST00000601370 1010 ntTSL 343.16■■■■■ 4.56e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.691e-31■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.826e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.86e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-31■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 H3F3A-202ENST00000366814 1863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.181e-31■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.941e-21■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 546.14■■■■■ 4.981e-21■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 329.62■■■□□ 2.331e-21■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.591e-21■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-12■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.422e-6■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CLUH-214ENST00000576885 583 ntTSL 323.01■■□□□ 1.277e-8■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CLUH-204ENST00000571566 545 ntTSL 420.37■□□□□ 0.857e-8■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CLUH-210ENST00000574426 3844 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.42■□□□□ 0.77e-8■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-8■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.237e-8■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.812e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.462e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.732e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 21.2
GEMIN5Q8TEQ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.962e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 216.19■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.453e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 542.43■■■■■ 4.384e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.194e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 540.21■■■■■ 4.034e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 539.5■■■■□ 3.914e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.674e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 537.42■■■■□ 3.584e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.014e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.724e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PPP4R3A-211ENST00000557018 534 ntTSL 528.21■■■□□ 2.112e-10■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PPP4R3A-202ENST00000554390 2953 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.082e-10■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.062e-10■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 MCM5-203ENST00000416905 739 ntTSL 321.44■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 MCM5-206ENST00000451351 450 ntTSL 417.8■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 MCM5-204ENST00000417343 557 ntTSL 58.9□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 234.38■■■■□ 3.092e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.842e-6■■■■□ 21.1
GEMIN5Q8TEQ6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.831e-6■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.881e-6■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.818e-7■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.123e-7■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.396e-7■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 532.07■■■□□ 2.725e-7■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 219.47■□□□□ 0.715e-7■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 21
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 425.73■■□□□ 1.719e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.629e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-208ENST00000490942 862 ntTSL 1 (best)24.88■■□□□ 1.579e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.519e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.289e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.019e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.749e-16■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.635e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.635e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)33.61■■■□□ 2.972e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 533.02■■■□□ 2.882e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 231.34■■■□□ 2.612e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 426.68■■□□□ 1.862e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.752e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 425.63■■□□□ 1.692e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 425.19■■□□□ 1.622e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 523.03■■□□□ 1.282e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)22.53■■□□□ 1.22e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 318.73■□□□□ 0.592e-34■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 431.81■■■□□ 2.683e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 527.58■■■□□ 2.013e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 CFL1-215ENST00000534784 737 ntTSL 330.12■■■□□ 2.411e-8■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-204ENST00000594212 1132 ntTSL 1 (best)35.43■■■■□ 3.267e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-212ENST00000597681 947 ntTSL 332.43■■■□□ 2.787e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-207ENST00000594625 585 ntAPPRIS ALT2 TSL 426.12■■□□□ 1.777e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-221ENST00000601544 598 ntTSL 425.86■■□□□ 1.737e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-218ENST00000600186 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.38■■□□□ 1.657e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-213ENST00000597735 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.07■■□□□ 1.67e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-219ENST00000600608 539 ntTSL 423.82■■□□□ 1.47e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.037e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.667e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 219■□□□□ 0.637e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.587e-6■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 227.53■■■□□ 25e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 325.81■■□□□ 1.725e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)21.14■□□□□ 0.985e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 516.99■□□□□ 0.315e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.295e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.235e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.25e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-9■■■■□ 20.9
GEMIN5Q8TEQ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.874e-10■■■■□ 20.8
Retrieved 100 of 19,123 protein–RNA pairs in 78.6 ms