RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573401.6

PCYT2-213, Transcript of phosphate cytidylyltransferase 2, ethanolamine, human

TSL 5

Gene PCYT2, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCYT2-213	ENST00000573401	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		61	■■■■■ 7.36
PCYT2-213	ENST00000573401	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		54.4	■■■■■ 6.3
PCYT2-213	ENST00000573401	ABCC9	O60706	1549 aa		53.43	■■■■■ 6.14
PCYT2-213	ENST00000573401	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.23	■■■■■ 5.79
PCYT2-213	ENST00000573401	NACAD	O15069	1562 aa		51.13	■■■■■ 5.78
PCYT2-213	ENST00000573401	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	50.79	■■■■■ 5.72
PCYT2-213	ENST00000573401	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		50.79	■■■■■ 5.72
PCYT2-213	ENST00000573401	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		50.71	■■■■■ 5.71
PCYT2-213	ENST00000573401	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		50.46	■■■■■ 5.67
PCYT2-213	ENST00000573401	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		50.36	■■■■■ 5.65
PCYT2-213	ENST00000573401	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.95	■■■■■ 5.59
PCYT2-213	ENST00000573401	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.82	■■■■■ 5.57	2e-7	■■□□□ 13.8
PCYT2-213	ENST00000573401	SCRIB	Q14160	1630 aa		49.56	■■■■■ 5.52
PCYT2-213	ENST00000573401	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.48	■■■■■ 5.51
PCYT2-213	ENST00000573401	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		49.17	■■■■■ 5.46
PCYT2-213	ENST00000573401	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.51	■■■■■ 5.36
PCYT2-213	ENST00000573401	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.4	■■■■■ 5.34
PCYT2-213	ENST00000573401	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.03	■■■■■ 5.28
PCYT2-213	ENST00000573401	SMARCA4	P51532	1647 aa		47.43	■■■■■ 5.18
PCYT2-213	ENST00000573401	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	47.23	■■■■■ 5.15
PCYT2-213	ENST00000573401	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.21	■■■■■ 5.15
PCYT2-213	ENST00000573401	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47.21	■■■■■ 5.15
PCYT2-213	ENST00000573401	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.06	■■■■■ 5.12
PCYT2-213	ENST00000573401	SMARCA2	P51531	1590 aa		47.05	■■■■■ 5.12
PCYT2-213	ENST00000573401	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.02	■■■■■ 5.12
PCYT2-213	ENST00000573401	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.98	■■■■■ 5.11
PCYT2-213	ENST00000573401	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	46.7	■■■■■ 5.07
PCYT2-213	ENST00000573401	WIZ	O95785	1651 aa		46.55	■■■■■ 5.04
PCYT2-213	ENST00000573401	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	46.35	■■■■■ 5.01
PCYT2-213	ENST00000573401	NES	P48681	1621 aa		46.25	■■■■■ 4.99
PCYT2-213	ENST00000573401	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46	■■■■■ 4.95
PCYT2-213	ENST00000573401	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.96	■■■■■ 4.95
PCYT2-213	ENST00000573401	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.92	■■■■■ 4.94
PCYT2-213	ENST00000573401	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.75	■■■■■ 4.91
PCYT2-213	ENST00000573401	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.74	■■■■■ 4.91
PCYT2-213	ENST00000573401	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.68	■■■■■ 4.9
PCYT2-213	ENST00000573401	CUX2	O14529	1486 aa		45.68	■■■■■ 4.9
PCYT2-213	ENST00000573401	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.56	■■■■■ 4.88
PCYT2-213	ENST00000573401	CFTR	P13569	1480 aa		45.49	■■■■■ 4.87
PCYT2-213	ENST00000573401	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		45.42	■■■■■ 4.86
PCYT2-213	ENST00000573401	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.24	■■■■■ 4.83
PCYT2-213	ENST00000573401	PRDM2	Q13029	1718 aa		45.22	■■■■■ 4.83
PCYT2-213	ENST00000573401	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.22	■■■■■ 4.83
PCYT2-213	ENST00000573401	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.18	■■■■■ 4.82
PCYT2-213	ENST00000573401	WDR62	O43379	1518 aa		45.18	■■■■■ 4.82
PCYT2-213	ENST00000573401	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.94	■■■■■ 4.78
PCYT2-213	ENST00000573401	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.67	■■■■■ 4.74
PCYT2-213	ENST00000573401	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.63	■■■■■ 4.74
PCYT2-213	ENST00000573401	TOPBP1	Q92547	1522 aa		44.55	■■■■■ 4.72
PCYT2-213	ENST00000573401	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		44.46	■■■■■ 4.71
PCYT2-213	ENST00000573401	ABCC8	Q09428	1581 aa		44.35	■■■■■ 4.69
PCYT2-213	ENST00000573401	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.25	■■■■■ 4.67
PCYT2-213	ENST00000573401	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.23	■■■■■ 4.67
PCYT2-213	ENST00000573401	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.19	■■■■■ 4.66
PCYT2-213	ENST00000573401	CUX1	P39880	1505 aa		44.16	■■■■■ 4.66
PCYT2-213	ENST00000573401	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.15	■■■■■ 4.66
PCYT2-213	ENST00000573401	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.03	■■■■■ 4.64
PCYT2-213	ENST00000573401	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.98	■■■■■ 4.63
PCYT2-213	ENST00000573401	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.97	■■■■■ 4.63
PCYT2-213	ENST00000573401	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.85	■■■■■ 4.61	2e-8	■■■■■ 35.5
PCYT2-213	ENST00000573401	SOGA1	O94964	1423 aa		43.84	■■■■■ 4.61
PCYT2-213	ENST00000573401	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.81	■■■■■ 4.6
PCYT2-213	ENST00000573401	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		43.7	■■■■■ 4.59
PCYT2-213	ENST00000573401	SYNJ1	O43426	1573 aa		43.69	■■■■■ 4.58
PCYT2-213	ENST00000573401	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.67	■■■■■ 4.58
PCYT2-213	ENST00000573401	TOP2B	Q02880	1626 aa		43.66	■■■■■ 4.58
PCYT2-213	ENST00000573401	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.6	■■■■■ 4.57
PCYT2-213	ENST00000573401	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.57	■■■■■ 4.57
PCYT2-213	ENST00000573401	CHD1	O14646	1710 aa		43.56	■■■■■ 4.56
PCYT2-213	ENST00000573401	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		43.55	■■■■■ 4.56
PCYT2-213	ENST00000573401	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.49	■■■■■ 4.55
PCYT2-213	ENST00000573401	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.44	■■■■■ 4.54
PCYT2-213	ENST00000573401	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.43	■■■■■ 4.54
PCYT2-213	ENST00000573401	GRIN2B	Q13224	1484 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PCYT2-213	ENST00000573401	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.37	■■■■■ 4.53
PCYT2-213	ENST00000573401	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
PCYT2-213	ENST00000573401	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PCYT2-213	ENST00000573401	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PCYT2-213	ENST00000573401	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PCYT2-213	ENST00000573401	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PCYT2-213	ENST00000573401	FBLN2	P98095	1184 aa		43.12	■■■■■ 4.49
PCYT2-213	ENST00000573401	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.1	■■■■■ 4.49
PCYT2-213	ENST00000573401	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PCYT2-213	ENST00000573401	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PCYT2-213	ENST00000573401	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PCYT2-213	ENST00000573401	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.99	■■■■■ 4.47
PCYT2-213	ENST00000573401	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.89	■■■■■ 4.46
PCYT2-213	ENST00000573401	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PCYT2-213	ENST00000573401	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PCYT2-213	ENST00000573401	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PCYT2-213	ENST00000573401	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PCYT2-213	ENST00000573401	NUP160	Q12769	1436 aa		42.77	■■■■■ 4.44
PCYT2-213	ENST00000573401	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PCYT2-213	ENST00000573401	IGF1R	P08069	1367 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PCYT2-213	ENST00000573401	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.57	■■■■■ 4.4
PCYT2-213	ENST00000573401	CUL7	Q14999	1698 aa		42.54	■■■■■ 4.4
PCYT2-213	ENST00000573401	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.53	■■■■■ 4.4
PCYT2-213	ENST00000573401	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.51	■■■■■ 4.4
PCYT2-213	ENST00000573401	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PCYT2-213	ENST00000573401	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.28	■■■■■ 4.36

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