Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-12■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 326.41■■□□□ 1.823e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 325.21■■□□□ 1.633e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.543e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.323e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 522.78■■□□□ 1.243e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-208ENST00000474116 866 ntTSL 218.14■□□□□ 0.493e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.793e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 516.17■□□□□ 0.187e-14■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 515.29■□□□□ 0.047e-14■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 MED24-230ENST00000584077 552 ntTSL 314.99□□□□□ -0.017e-14■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.587e-14■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.047e-14■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.652e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 SRP68-210ENST00000591272 507 ntTSL 312.68□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.987e-8■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.93■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.018e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.138e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.218e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 PHLDB1-207ENST00000526374 591 ntTSL 221.16■□□□□ 0.989e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.299e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.839e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 KDM4C-204ENST00000420847 1064 ntTSL 59.5□□□□□ -0.899e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.989e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.259e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.329e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 36.29□□□□□ -1.49e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 56.08□□□□□ -1.449e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.549e-7■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.018e-18■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 24.7
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TARDBPQ13148 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 317.11■□□□□ 0.336e-15■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.36e-15■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.286e-15■■■■□ 24.7
TARDBPQ13148 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 512.26□□□□□ -0.459e-9■■■■□ 24.6
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TARDBPQ13148 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 311.92□□□□□ -0.59e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 311.23□□□□□ -0.619e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRAPPC12-204ENST00000415624 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.4□□□□□ -0.749e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 210.25□□□□□ -0.779e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRAPPC12-215ENST00000469147 1002 ntTSL 39.46□□□□□ -0.99e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 48.99□□□□□ -0.979e-9■■■■□ 24.6
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TARDBPQ13148 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 210.92□□□□□ -0.663e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 UBR4-209ENST00000465036 392 ntTSL 25.71□□□□□ -1.53e-9■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TBL1XR1-227ENST00000636478 100 ntTSL 51.58□□□□□ -2.167e-7■■■■□ 24.6
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TARDBPQ13148 FBXL3-204ENST00000472949 329 ntTSL 526.17■■□□□ 1.781e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 24.6
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TARDBPQ13148 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.583e-7■■■■□ 24.6
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TARDBPQ13148 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.363e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.638e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.396e-7■■■■□ 24.6
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TARDBPQ13148 SEPT2-229ENST00000466211 584 ntTSL 323.76■■□□□ 1.391e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-243ENST00000494824 565 ntTSL 522.29■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 TEAD1-204ENST00000527376 477 ntTSL 321.52■■□□□ 1.045e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCAP-204ENST00000416847 683 ntTSL 320.66■□□□□ 0.91e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCART1-205ENST00000488261 4709 ntTSL 219.05■□□□□ 0.641e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-208ENST00000555806 565 ntTSL 418.47■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-211ENST00000421717 818 ntTSL 418.03■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-213ENST00000428282 1005 ntTSL 317.81■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-210ENST00000557400 604 ntTSL 517.62■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-212ENST00000557478 595 ntTSL 517.57■□□□□ 0.41e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-207ENST00000555114 731 ntTSL 315.96■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.65■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.021e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 214.92□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 24.6
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