RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417323.1

FBXL3-202, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene FBXL3, Length 1,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3-202ENST00000417323 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.31■■■■■ 8.37
FBXL3-202ENST00000417323 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.4■■■■■ 7.26
FBXL3-202ENST00000417323 ABCC9O60706 1549 aa59.95■■■■■ 7.19
FBXL3-202ENST00000417323 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.29■■■■■ 6.76
FBXL3-202ENST00000417323 NACADO15069 1562 aa56.96■■■■■ 6.71
FBXL3-202ENST00000417323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.63■■■■■ 6.66
FBXL3-202ENST00000417323 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.26■■■■■ 6.6
FBXL3-202ENST00000417323 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.09■■■■■ 6.57
FBXL3-202ENST00000417323 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.86■■■■■ 6.53
FBXL3-202ENST00000417323 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.85■■■■■ 6.53
FBXL3-202ENST00000417323 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.8■■■■■ 6.52
FBXL3-202ENST00000417323 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.65■■■■■ 6.5
FBXL3-202ENST00000417323 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.55■■■■■ 6.48
FBXL3-202ENST00000417323 SCRIBQ14160 1630 aa54.98■■■■■ 6.39
FBXL3-202ENST00000417323 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.88■■■■■ 6.38
FBXL3-202ENST00000417323 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.23■■■■■ 6.27
FBXL3-202ENST00000417323 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.18■■■■■ 6.26
FBXL3-202ENST00000417323 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.98■■■■■ 6.23
FBXL3-202ENST00000417323 NCAPD3P42695 1498 aa52.51■■■■■ 6
FBXL3-202ENST00000417323 SMARCA4P51532 1647 aa52.49■■■■■ 5.99
FBXL3-202ENST00000417323 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.39■■■■■ 5.98
FBXL3-202ENST00000417323 SMARCA2P51531 1590 aa52.34■■■■■ 5.97
FBXL3-202ENST00000417323 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.28■■■■■ 5.96
FBXL3-202ENST00000417323 HMGXB3Q12766 1538 aa52.21■■■■■ 5.95
FBXL3-202ENST00000417323 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.97■■■■■ 5.91
FBXL3-202ENST00000417323 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.94■■■■■ 5.91
FBXL3-202ENST00000417323 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.85■■■■■ 5.89
FBXL3-202ENST00000417323 ERCC6Q03468 1493 aa51.78■■■■■ 5.88
FBXL3-202ENST00000417323 CUX2O14529 1486 aa51.58■■■■■ 5.85
FBXL3-202ENST00000417323 NESP48681 1621 aa51.57■■■■■ 5.85
FBXL3-202ENST00000417323 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.36■■■■■ 5.81
FBXL3-202ENST00000417323 WIZO95785 1651 aa51.31■■■■■ 5.8
FBXL3-202ENST00000417323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.12■■■■■ 5.77
FBXL3-202ENST00000417323 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
FBXL3-202ENST00000417323 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.06■■■■■ 5.76
FBXL3-202ENST00000417323 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51■■■■■ 5.75
FBXL3-202ENST00000417323 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.92■■■■■ 5.74
FBXL3-202ENST00000417323 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.86■■■■■ 5.73
FBXL3-202ENST00000417323 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.67■■■■■ 5.7
FBXL3-202ENST00000417323 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.54■■■■■ 5.68
FBXL3-202ENST00000417323 WDR62O43379 1518 aa50.43■■■■■ 5.66
FBXL3-202ENST00000417323 CFTRP13569 1480 aa50.42■■■■■ 5.66
FBXL3-202ENST00000417323 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.42■■■■■ 5.66
FBXL3-202ENST00000417323 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.37■■■■■ 5.65
FBXL3-202ENST00000417323 PRDM2Q13029 1718 aa50.17■■■■■ 5.62
FBXL3-202ENST00000417323 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.04■■■■■ 5.6
FBXL3-202ENST00000417323 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.92■■■■■ 5.58
FBXL3-202ENST00000417323 TOPBP1Q92547 1522 aa49.46■■■■■ 5.51
FBXL3-202ENST00000417323 ABCC8Q09428 1581 aa49.42■■■■■ 5.5
FBXL3-202ENST00000417323 IFT140Q96RY7 1462 aa49.39■■■■■ 5.5
FBXL3-202ENST00000417323 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.35■■■■■ 5.49
FBXL3-202ENST00000417323 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.24■■■■■ 5.47
FBXL3-202ENST00000417323 OSCARQ8IYS5 282 aa49.23■■■■■ 5.47
FBXL3-202ENST00000417323 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.07■■■■■ 5.45
FBXL3-202ENST00000417323 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
FBXL3-202ENST00000417323 TRIM41Q8WV44 630 aa49.02■■■■■ 5.44
FBXL3-202ENST00000417323 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.97■■■■■ 5.43
FBXL3-202ENST00000417323 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
FBXL3-202ENST00000417323 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.82■■■■■ 5.413e-6■■■■□ 25.2
FBXL3-202ENST00000417323 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.75■■■■■ 5.4
FBXL3-202ENST00000417323 SOGA1O94964 1423 aa48.74■■■■■ 5.39
FBXL3-202ENST00000417323 CHD1O14646 1710 aa48.72■■■■■ 5.39
FBXL3-202ENST00000417323 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.71■■■■■ 5.39
FBXL3-202ENST00000417323 CUX1P39880 1505 aa48.71■■■■■ 5.39
FBXL3-202ENST00000417323 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.64■■■■■ 5.38
FBXL3-202ENST00000417323 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.64■■■■■ 5.38
FBXL3-202ENST00000417323 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.64■■■■■ 5.38
FBXL3-202ENST00000417323 WDR97A6NE52 1622 aa48.61■■■■■ 5.37
FBXL3-202ENST00000417323 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
FBXL3-202ENST00000417323 ARHGEF11O15085 1522 aa48.48■■■■■ 5.35
FBXL3-202ENST00000417323 FBLN2P98095 1184 aa48.45■■■■■ 5.35
FBXL3-202ENST00000417323 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.38■■■■■ 5.34
FBXL3-202ENST00000417323 GRIN2BQ13224 1484 aa48.3■■■■■ 5.32
FBXL3-202ENST00000417323 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
FBXL3-202ENST00000417323 PBRM1Q86U86 1689 aa48.26■■■■■ 5.32
FBXL3-202ENST00000417323 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.17■■■■■ 5.3
FBXL3-202ENST00000417323 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.17■■■■■ 5.3
FBXL3-202ENST00000417323 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.16■■■■■ 5.3
FBXL3-202ENST00000417323 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.13■■■■■ 5.3
FBXL3-202ENST00000417323 SYNJ1O43426 1573 aa48.12■■■■■ 5.29
FBXL3-202ENST00000417323 SYNJ2O15056 1496 aa48.11■■■■■ 5.29
FBXL3-202ENST00000417323 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.1■■■■■ 5.29
FBXL3-202ENST00000417323 TOP2BQ02880 1626 aa48.07■■■■■ 5.29
FBXL3-202ENST00000417323 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.07■■■■■ 5.29
FBXL3-202ENST00000417323 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.04■■■■■ 5.28
FBXL3-202ENST00000417323 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.04■■■■■ 5.28
FBXL3-202ENST00000417323 ARAP1Q96P48 1450 aa47.99■■■■■ 5.27
FBXL3-202ENST00000417323 ADAMTS12P58397 1594 aa47.73■■■■■ 5.23
FBXL3-202ENST00000417323 GRIN2AQ12879 1464 aa47.68■■■■■ 5.22
FBXL3-202ENST00000417323 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.61■■■■■ 5.21
FBXL3-202ENST00000417323 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.56■■■■■ 5.2
FBXL3-202ENST00000417323 CEP170Q5SW79 1584 aa47.51■■■■■ 5.2
FBXL3-202ENST00000417323 NUP160Q12769 1436 aa47.48■■■■■ 5.19
FBXL3-202ENST00000417323 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
FBXL3-202ENST00000417323 SHROOM2Q13796 1616 aa47.31■■■■■ 5.16
FBXL3-202ENST00000417323 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.31■■■■■ 5.16
FBXL3-202ENST00000417323 KIF27Q86VH2 1401 aa47.1■■■■■ 5.13
FBXL3-202ENST00000417323 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.06■■■■■ 5.12
FBXL3-202ENST00000417323 CUL7Q14999 1698 aa47.05■■■■■ 5.12
FBXL3-202ENST00000417323 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.11
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