RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.93■■■■■ 4.46
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.34■■■■□ 3.73
NEDD1-212ENST00000557478 ABCC9O60706 1549 aa37.8■■■■□ 3.64
NEDD1-212ENST00000557478 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.33■■■■□ 3.41
NEDD1-212ENST00000557478 NACADO15069 1562 aa36.23■■■■□ 3.39
NEDD1-212ENST00000557478 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.02■■■■□ 3.36
NEDD1-212ENST00000557478 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
NEDD1-212ENST00000557478 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
NEDD1-212ENST00000557478 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.62■■■■□ 3.29
NEDD1-212ENST00000557478 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.24
NEDD1-212ENST00000557478 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.2■■■■□ 3.23
NEDD1-212ENST00000557478 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.07■■■■□ 3.2
NEDD1-212ENST00000557478 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.02■■■■□ 3.2
NEDD1-212ENST00000557478 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35■■■■□ 3.19
NEDD1-212ENST00000557478 SCRIBQ14160 1630 aa34.81■■■■□ 3.16
NEDD1-212ENST00000557478 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
NEDD1-212ENST00000557478 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.18■■■■□ 3.06
NEDD1-212ENST00000557478 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.1■■■■□ 3.05
NEDD1-212ENST00000557478 NCAPD3P42695 1498 aa33.44■■■□□ 2.94
NEDD1-212ENST00000557478 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
NEDD1-212ENST00000557478 SMARCA4P51532 1647 aa33.34■■■□□ 2.93
NEDD1-212ENST00000557478 SMARCA2P51531 1590 aa33.34■■■□□ 2.93
NEDD1-212ENST00000557478 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.32■■■□□ 2.92
NEDD1-212ENST00000557478 HMGXB3Q12766 1538 aa33.21■■■□□ 2.91
NEDD1-212ENST00000557478 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.11■■■□□ 2.89
NEDD1-212ENST00000557478 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
NEDD1-212ENST00000557478 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.98■■■□□ 2.87
NEDD1-212ENST00000557478 ERCC6Q03468 1493 aa32.74■■■□□ 2.83
NEDD1-212ENST00000557478 CUX2O14529 1486 aa32.61■■■□□ 2.81
NEDD1-212ENST00000557478 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.59■■■□□ 2.81
NEDD1-212ENST00000557478 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
NEDD1-212ENST00000557478 WIZO95785 1651 aa32.54■■■□□ 2.8
NEDD1-212ENST00000557478 NESP48681 1621 aa32.53■■■□□ 2.8
NEDD1-212ENST00000557478 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.48■■■□□ 2.79
NEDD1-212ENST00000557478 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.45■■■□□ 2.78
NEDD1-212ENST00000557478 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
NEDD1-212ENST00000557478 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
NEDD1-212ENST00000557478 CFTRP13569 1480 aa32.14■■■□□ 2.74
NEDD1-212ENST00000557478 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.09■■■□□ 2.73
NEDD1-212ENST00000557478 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.05■■■□□ 2.72
NEDD1-212ENST00000557478 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.04■■■□□ 2.72
NEDD1-212ENST00000557478 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.03■■■□□ 2.72
NEDD1-212ENST00000557478 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.01■■■□□ 2.71
NEDD1-212ENST00000557478 WDR62O43379 1518 aa31.93■■■□□ 2.7
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.92■■■□□ 2.7
NEDD1-212ENST00000557478 PRDM2Q13029 1718 aa31.69■■■□□ 2.66
NEDD1-212ENST00000557478 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
NEDD1-212ENST00000557478 ABCC8Q09428 1581 aa31.6■■■□□ 2.65
NEDD1-212ENST00000557478 IFT140Q96RY7 1462 aa31.42■■■□□ 2.62
NEDD1-212ENST00000557478 TOPBP1Q92547 1522 aa31.42■■■□□ 2.62
NEDD1-212ENST00000557478 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
NEDD1-212ENST00000557478 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.37■■■□□ 2.61
NEDD1-212ENST00000557478 OSCARQ8IYS5 282 aa31.21■■■□□ 2.59
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
NEDD1-212ENST00000557478 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
NEDD1-212ENST00000557478 SOGA1O94964 1423 aa31.07■■■□□ 2.56
NEDD1-212ENST00000557478 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
NEDD1-212ENST00000557478 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
NEDD1-212ENST00000557478 WDR97A6NE52 1622 aa30.99■■■□□ 2.55
NEDD1-212ENST00000557478 CUX1P39880 1505 aa30.98■■■□□ 2.55
NEDD1-212ENST00000557478 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.97■■■□□ 2.55
NEDD1-212ENST00000557478 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
NEDD1-212ENST00000557478 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.92■■■□□ 2.54
NEDD1-212ENST00000557478 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
NEDD1-212ENST00000557478 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.77■■■□□ 2.52
NEDD1-212ENST00000557478 GRIN2BQ13224 1484 aa30.76■■■□□ 2.52
NEDD1-212ENST00000557478 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
NEDD1-212ENST00000557478 FBLN2P98095 1184 aa30.74■■■□□ 2.51
NEDD1-212ENST00000557478 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.73■■■□□ 2.51
NEDD1-212ENST00000557478 TRIM41Q8WV44 630 aa30.69■■■□□ 2.5
NEDD1-212ENST00000557478 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
NEDD1-212ENST00000557478 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.68■■■□□ 2.5
NEDD1-212ENST00000557478 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.68■■■□□ 2.5
NEDD1-212ENST00000557478 TOP2BQ02880 1626 aa30.67■■■□□ 2.5
NEDD1-212ENST00000557478 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.62■■■□□ 2.49
NEDD1-212ENST00000557478 CHD1O14646 1710 aa30.6■■■□□ 2.49
NEDD1-212ENST00000557478 SYNJ2O15056 1496 aa30.6■■■□□ 2.49
NEDD1-212ENST00000557478 ARHGEF11O15085 1522 aa30.55■■■□□ 2.48
NEDD1-212ENST00000557478 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.55■■■□□ 2.48
NEDD1-212ENST00000557478 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.53■■■□□ 2.48
NEDD1-212ENST00000557478 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.53■■■□□ 2.48
NEDD1-212ENST00000557478 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.53■■■□□ 2.48
NEDD1-212ENST00000557478 SYNJ1O43426 1573 aa30.53■■■□□ 2.48
NEDD1-212ENST00000557478 PBRM1Q86U86 1689 aa30.47■■■□□ 2.47
NEDD1-212ENST00000557478 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.4■■■□□ 2.46
NEDD1-212ENST00000557478 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.38■■■□□ 2.45
NEDD1-212ENST00000557478 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.36■■■□□ 2.45
NEDD1-212ENST00000557478 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.34■■■□□ 2.45
NEDD1-212ENST00000557478 GRIN2AQ12879 1464 aa30.31■■■□□ 2.44
NEDD1-212ENST00000557478 ADAMTS12P58397 1594 aa30.29■■■□□ 2.44
NEDD1-212ENST00000557478 ARAP1Q96P48 1450 aa30.25■■■□□ 2.43
NEDD1-212ENST00000557478 NUP160Q12769 1436 aa30.22■■■□□ 2.43
NEDD1-212ENST00000557478 KIF27Q86VH2 1401 aa30.21■■■□□ 2.43
NEDD1-212ENST00000557478 CEP170Q5SW79 1584 aa30.07■■■□□ 2.4
NEDD1-212ENST00000557478 IGF1RP08069 1367 aa30.06■■■□□ 2.4
NEDD1-212ENST00000557478 CUL7Q14999 1698 aa29.99■■■□□ 2.39
NEDD1-212ENST00000557478 SHROOM2Q13796 1616 aa29.96■■■□□ 2.39
NEDD1-212ENST00000557478 JPH4Q96JJ6 628 aa29.96■■■□□ 2.39
NEDD1-212ENST00000557478 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.9■■■□□ 2.38
NEDD1-212ENST00000557478 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms