Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 VEGFA-211ENST00000476772 1683 ntTSL 1 (best)33.22■■■□□ 2.911e-19■□□□□ 9.7
FTOQ9C0B1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.781e-19■□□□□ 9.7
FTOQ9C0B1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.497e-10■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 516.56■□□□□ 0.249e-9■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 221.48■■□□□ 1.031e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-206ENST00000566391 806 ntTSL 221.18■□□□□ 0.981e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 519.66■□□□□ 0.741e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 216.78■□□□□ 0.281e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.051e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.171e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.31e-16■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 LRPAP1-203ENST00000509198 1170 ntTSL 222.61■■□□□ 1.214e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)21.14■□□□□ 0.974e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 LRPAP1-204ENST00000515119 1167 ntTSL 218.48■□□□□ 0.554e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 518.26■□□□□ 0.514e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.14e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 G3BP2-201ENST00000357854 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.124e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.254e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 G3BP2-211ENST00000507947 665 ntTSL 27.31□□□□□ -1.244e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 G3BP2-215ENST00000510902 338 ntTSL 32.66□□□□□ -1.984e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DHCR7-209ENST00000531364 507 ntTSL 425.54■■□□□ 1.685e-10■□□□□ 9.6
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FTOQ9C0B1 DHCR7-208ENST00000529990 525 ntTSL 423.75■■□□□ 1.395e-10■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.855e-10■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DHCR7-204ENST00000525346 520 ntTSL 419.19■□□□□ 0.665e-10■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.465e-10■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DHCR7-207ENST00000527452 579 ntTSL 416.65■□□□□ 0.265e-10■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.964e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.854e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 TMUB1-206ENST00000488752 584 ntTSL 225.36■■□□□ 1.654e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 TMUB1-207ENST00000492838 550 ntTSL 512.41□□□□□ -0.424e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.542e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 313.56□□□□□ -0.248e-7■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-205ENST00000533239 738 ntTSL 219.39■□□□□ 0.693e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-201ENST00000525082 1232 ntTSL 211.57□□□□□ -0.563e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-204ENST00000531971 4373 ntTSL 38.18□□□□□ -1.13e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.193e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.883e-12■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 AL121845.2-202ENST00000476221 446 ntTSL 520.3■□□□□ 0.842e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 9.6
FTOQ9C0B1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.61e-6■□□□□ 9.6
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FTOQ9C0B1 CHML-203ENST00000638018 705 ntTSL 330.52■■■□□ 2.488e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 OPN3-204ENST00000469376 1961 ntTSL 1 (best)30.21■■■□□ 2.438e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.238e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 OPN3-205ENST00000478849 880 ntTSL 328.65■■■□□ 2.188e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 OPN3-206ENST00000490673 1816 ntTSL 1 (best)25.88■■□□□ 1.738e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.658e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.648e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HEXB-213ENST00000515528 876 ntTSL 225■■□□□ 1.598e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HEXB-209ENST00000513079 1684 ntTSL 224.66■■□□□ 1.548e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.038e-11■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 CHML-201ENST00000366553 7594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.378e-11■□□□□ 9.5
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FTOQ9C0B1 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.734e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 RPL24-202ENST00000464595 668 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.964e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.244e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HIST1H1E-201ENST00000304218 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-35■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SNRNP25-201ENST00000293861 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)24.98■■□□□ 1.592e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.392e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.292e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 217.68■□□□□ 0.422e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 316.58■□□□□ 0.242e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SNRNP25-207ENST00000493672 329 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-9■□□□□ 9.5
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FTOQ9C0B1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.873e-7■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 322.89■■□□□ 1.253e-8■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HS3ST3B1-202ENST00000466596 2808 ntTSL 217.75■□□□□ 0.431e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 RRBP1-207ENST00000468428 2200 ntTSL 219.46■□□□□ 0.714e-22■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.324e-8■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 TAF7-203ENST00000624761 603 ntTSL 422.7■■□□□ 1.224e-8■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 37.99□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.535e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SMDT1-203ENST00000484235 556 ntTSL 1 (best)29.93■■■□□ 2.386e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SMDT1-202ENST00000422252 591 ntTSL 229.33■■■□□ 2.296e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.286e-9■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.765e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)24.58■■□□□ 1.535e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.525e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.425e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SDCBP-209ENST00000522243 556 ntTSL 523.85■■□□□ 1.415e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.175e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.095e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 HSP90AA1-208ENST00000557234 584 ntTSL 321.42■■□□□ 1.023e-10■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.015e-6■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 13e-10■□□□□ 9.5
FTOQ9C0B1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.991e-11■□□□□ 9.5
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