RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.81■■■■■ 5.24
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.56■■■■■ 4.24
SNRNP25-201ENST00000293861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.57■■■■□ 3.93
SNRNP25-201ENST00000293861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.27■■■■□ 3.88
SNRNP25-201ENST00000293861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.16■■■■□ 3.86
SNRNP25-201ENST00000293861 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.98■■■■□ 3.83
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC9O60706 1549 aa38.91■■■■□ 3.82
SNRNP25-201ENST00000293861 NACADO15069 1562 aa38.62■■■■□ 3.77
SNRNP25-201ENST00000293861 SCRIBQ14160 1630 aa38.21■■■■□ 3.71
SNRNP25-201ENST00000293861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.19■■■■□ 3.7
SNRNP25-201ENST00000293861 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
SNRNP25-201ENST00000293861 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.42■■■■□ 3.58
SNRNP25-201ENST00000293861 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
SNRNP25-201ENST00000293861 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.08■■■■□ 3.53
SNRNP25-201ENST00000293861 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.02■■■■□ 3.52
SNRNP25-201ENST00000293861 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.93■■■■□ 3.5
SNRNP25-201ENST00000293861 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
SNRNP25-201ENST00000293861 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCA4P51532 1647 aa36.68■■■■□ 3.46
SNRNP25-201ENST00000293861 WIZO95785 1651 aa36.64■■■■□ 3.46
SNRNP25-201ENST00000293861 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.61■■■■□ 3.45
SNRNP25-201ENST00000293861 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
SNRNP25-201ENST00000293861 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.25■■■■□ 3.39
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCA2P51531 1590 aa36■■■■□ 3.35
SNRNP25-201ENST00000293861 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.98■■■■□ 3.35
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.91■■■■□ 3.34
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
SNRNP25-201ENST00000293861 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
SNRNP25-201ENST00000293861 HMGXB3Q12766 1538 aa35.63■■■■□ 3.29
SNRNP25-201ENST00000293861 NCAPD3P42695 1498 aa35.62■■■■□ 3.29
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM41Q8WV44 630 aa35.62■■■■□ 3.29
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC8Q09428 1581 aa35.25■■■■□ 3.23
SNRNP25-201ENST00000293861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.25■■■■□ 3.23
SNRNP25-201ENST00000293861 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.19■■■■□ 3.22
SNRNP25-201ENST00000293861 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.2
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
SNRNP25-201ENST00000293861 CFTRP13569 1480 aa34.93■■■■□ 3.18
SNRNP25-201ENST00000293861 SYNJ1O43426 1573 aa34.85■■■■□ 3.17
SNRNP25-201ENST00000293861 PRDM2Q13029 1718 aa34.8■■■■□ 3.16
SNRNP25-201ENST00000293861 EEA1Q15075 1411 aa34.75■■■■□ 3.15
SNRNP25-201ENST00000293861 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.73■■■■□ 3.15
SNRNP25-201ENST00000293861 TOP2BQ02880 1626 aa34.71■■■■□ 3.15
SNRNP25-201ENST00000293861 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.68■■■■□ 3.14
SNRNP25-201ENST00000293861 SOGA1O94964 1423 aa34.66■■■■□ 3.14
SNRNP25-201ENST00000293861 CUX1P39880 1505 aa34.52■■■■□ 3.12
SNRNP25-201ENST00000293861 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.52■■■■□ 3.12
SNRNP25-201ENST00000293861 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.46■■■■□ 3.11
SNRNP25-201ENST00000293861 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.38■■■■□ 3.09
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.36■■■■□ 3.09
SNRNP25-201ENST00000293861 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.34■■■■□ 3.09
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF21BO75037 1637 aa34.31■■■■□ 3.08
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLGA3Q08378 1498 aa34.27■■■■□ 3.08
SNRNP25-201ENST00000293861 NESP48681 1621 aa34.27■■■■□ 3.08
SNRNP25-201ENST00000293861 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.26■■■■□ 3.08
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.23■■■■□ 3.07
SNRNP25-201ENST00000293861 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.17■■■■□ 3.06
SNRNP25-201ENST00000293861 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.12■■■■□ 3.05
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF27Q86VH2 1401 aa34.11■■■■□ 3.05
SNRNP25-201ENST00000293861 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.11■■■■□ 3.05
SNRNP25-201ENST00000293861 CEP162Q5TB80 1403 aa34.1■■■■□ 3.05
SNRNP25-201ENST00000293861 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.08■■■■□ 3.05
SNRNP25-201ENST00000293861 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.08■■■■□ 3.05
SNRNP25-201ENST00000293861 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SNRNP25-201ENST00000293861 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SNRNP25-201ENST00000293861 TOPBP1Q92547 1522 aa34.02■■■■□ 3.04
SNRNP25-201ENST00000293861 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
SNRNP25-201ENST00000293861 PRXQ9BXM0 1461 aa33.97■■■■□ 3.03
SNRNP25-201ENST00000293861 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.96■■■■□ 3.03
SNRNP25-201ENST00000293861 CUX2O14529 1486 aa33.92■■■■□ 3.02
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.89■■■■□ 3.02
SNRNP25-201ENST00000293861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
SNRNP25-201ENST00000293861 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.81■■■■□ 3
SNRNP25-201ENST00000293861 IGF1RP08069 1367 aa33.75■■■□□ 2.99
SNRNP25-201ENST00000293861 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.74■■■□□ 2.99
SNRNP25-201ENST00000293861 CLIP1P30622 1438 aa33.71■■■□□ 2.99
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR97A6NE52 1622 aa33.68■■■□□ 2.98
SNRNP25-201ENST00000293861 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.62■■■□□ 2.97
SNRNP25-201ENST00000293861 HRCP23327 699 aa33.61■■■□□ 2.97
SNRNP25-201ENST00000293861 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.6■■■□□ 2.97
SNRNP25-201ENST00000293861 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.52■■■□□ 2.96
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.51■■■□□ 2.95
SNRNP25-201ENST00000293861 CUL7Q14999 1698 aa33.5■■■□□ 2.95
SNRNP25-201ENST00000293861 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
SNRNP25-201ENST00000293861 WDR62O43379 1518 aa33.44■■■□□ 2.94
SNRNP25-201ENST00000293861 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
SNRNP25-201ENST00000293861 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.41■■■□□ 2.94
SNRNP25-201ENST00000293861 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
SNRNP25-201ENST00000293861 ARAP1Q96P48 1450 aa33.36■■■□□ 2.93
SNRNP25-201ENST00000293861 ERCC6Q03468 1493 aa33.34■■■□□ 2.93
SNRNP25-201ENST00000293861 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
SNRNP25-201ENST00000293861 IFT140Q96RY7 1462 aa33.27■■■□□ 2.92
SNRNP25-201ENST00000293861 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
SNRNP25-201ENST00000293861 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.25■■■□□ 2.91
SNRNP25-201ENST00000293861 PBRM1Q86U86 1689 aa33.2■■■□□ 2.91
SNRNP25-201ENST00000293861 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.17■■■□□ 2.9
SNRNP25-201ENST00000293861 APLP2Q06481 763 aa33.12■■■□□ 2.89
SNRNP25-201ENST00000293861 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.1■■■□□ 2.891e-7■■■■■ 49.5
SNRNP25-201ENST00000293861 GRIN2BQ13224 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
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