RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 SCRIBQ14160 1630 aa22.91■■□□□ 1.26
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA3Q08378 1498 aa22.24■■□□□ 1.15
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 TSPY10P0CW01 314 aa22.11■■□□□ 1.13
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF27Q86VH2 1401 aa22.05■■□□□ 1.12
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC24A1O60721 1099 aa21.9■■□□□ 1.1
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.87■■□□□ 1.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.85■■□□□ 1.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.85■■□□□ 1.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 10.6
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRS2Q9HD23 443 aa21.8■■□□□ 1.08
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.78■■□□□ 1.08
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