Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 TKFC-209ENST00000529121 1510 ntTSL 518.88■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.516e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.516e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-219ENST00000476086 588 ntTSL 218.09■□□□□ 0.496e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 NR1H3-208ENST00000436029 911 ntTSL 516.51■□□□□ 0.236e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.29e-8■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 416.16■□□□□ 0.186e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.186e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.156e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 TKFC-205ENST00000525170 552 ntTSL 315.92■□□□□ 0.146e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 TKFC-204ENST00000524968 558 ntTSL 315.83■□□□□ 0.126e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 C15orf38-AP3S2-203ENST00000559629 675 ntTSL 315.48■□□□□ 0.076e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt15.11■□□□□ 0.016e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.016e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -06e-9■■■■■ 32.1
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SF3A3Q12874 RPAP1-209ENST00000566863 545 ntTSL 414.21□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 BAIAP3-208ENST00000564213 334 ntTSL 314.02□□□□□ -0.176e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-232ENST00000530310 542 ntTSL 414.02□□□□□ -0.176e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 TOMM40-206ENST00000592041 707 ntTSL 213.9□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.196e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-222ENST00000483882 572 ntTSL 213.86□□□□□ -0.196e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 GLB1-218ENST00000497796 899 ntTSL 313.8□□□□□ -0.26e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 C15orf38-AP3S2-204ENST00000560224 659 ntTSL 213.78□□□□□ -0.26e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 PASK-205ENST00000415234 538 ntTSL 313.27□□□□□ -0.296e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-215ENST00000461778 726 ntTSL 513.11□□□□□ -0.316e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 CLSTN3-213ENST00000541953 570 ntTSL 512.94□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 CLSTN3-216ENST00000545663 533 ntTSL 412.69□□□□□ -0.386e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 DMKN-230ENST00000469960 772 ntTSL 212.66□□□□□ -0.386e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.396e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-234ENST00000532630 549 ntTSL 312.56□□□□□ -0.46e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 DMKN-262ENST00000593342 271 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.39□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 NR1H3-213ENST00000449369 825 ntTSL 512.38□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 32.1
SF3A3Q12874 PKD1-231ENST00000566784 493 ntTSL 512.14□□□□□ -0.476e-9■■■■■ 32.1
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