RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570253.5

PKD1-240, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 5

Gene PKD1, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-240ENST00000570253 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.76■■■■■ 6.04
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PKD1-240ENST00000570253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.17■■■■■ 4.18
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PKD1-240ENST00000570253 CUX1P39880 1505 aa38.17■■■■□ 3.7
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PKD1-240ENST00000570253 SHROOM2Q13796 1616 aa37.27■■■■□ 3.56
PKD1-240ENST00000570253 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
PKD1-240ENST00000570253 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
PKD1-240ENST00000570253 JPH4Q96JJ6 628 aa37.07■■■■□ 3.52
PKD1-240ENST00000570253 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37■■■■□ 3.51
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