Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 210.71□□□□□ -0.693e-17■■■■■ 36.7
PCBP2Q15366 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.421e-323■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.471e-323■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 LMBR1-214ENST00000461469 560 ntTSL 322■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 KMT2C-207ENST00000452749 479 ntTSL 511.48□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-205ENST00000468686 1423 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.812e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-207ENST00000482998 1388 ntTSL 518.84■□□□□ 0.612e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-204ENST00000464015 1613 ntTSL 1 (best)18.51■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-206ENST00000473985 1494 ntTSL 518.17■□□□□ 0.52e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-203ENST00000415762 1410 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-208ENST00000568698 2026 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 NPRL3-202ENST00000419636 616 ntTSL 515.34■□□□□ 0.054e-20■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 312.23□□□□□ -0.454e-20■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 CDH16-206ENST00000567269 3539 ntTSL 211.85□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 PCED1A-205ENST00000474714 531 ntTSL 314.03□□□□□ -0.166e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 PCED1A-206ENST00000487501 712 ntTSL 311.13□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 312.56□□□□□ -0.48e-35■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 IFITM2-203ENST00000527146 634 ntTSL 312.27□□□□□ -0.458e-35■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.538e-35■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.568e-35■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 IFITM2-206ENST00000616316 892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.948e-35■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 411.57□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.551e-6■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 322.49■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 314.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 322.2■■□□□ 1.148e-12■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 519.95■□□□□ 0.788e-12■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 GNAS-251ENST00000492907 790 ntTSL 37.77□□□□□ -1.178e-12■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.678e-12■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 516.33■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.426e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 L3HYPDH-209ENST00000543619 689 ntTSL 39.3□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 L3HYPDH-208ENST00000532049 612 ntTSL 28.98□□□□□ -0.976e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 L3HYPDH-204ENST00000478430 729 ntTSL 26.86□□□□□ -1.316e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 L3HYPDH-203ENST00000466522 462 ntTSL 36.14□□□□□ -1.436e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 L3HYPDH-202ENST00000463432 476 ntTSL 32.12□□□□□ -2.076e-9■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 TRIM66-208ENST00000531498 1210 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.011e-11■■■■■ 36.6
PCBP2Q15366 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 NCK2-202ENST00000393348 790 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.494e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.124e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 210.92□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 36.5
PCBP2Q15366 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 49.09□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 36.4
PCBP2Q15366 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 413.65□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 36.4
PCBP2Q15366 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 413.65□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 36.4
PCBP2Q15366 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 36.4
PCBP2Q15366 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 ASMTL-AS1-204ENST00000443929 574 ntTSL 215.44■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-42■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 AHCY-206ENST00000606061 1170 ntTSL 218.93■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 513.2□□□□□ -0.35e-8■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-8■■■■■ 36.3
PCBP2Q15366 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-16■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.791e-16■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 312.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 SHANK2-212ENST00000458632 635 ntTSL 311.9□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 BRD4-205ENST00000594841 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.144e-15■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.098e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PPM1H-203ENST00000548414 522 ntTSL 319.71■□□□□ 0.756e-8■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.258e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.138e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.468e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.518e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.528e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.578e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 AC009779.3-201ENST00000551946 1024 ntTSL 211.18□□□□□ -0.628e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 AC009779.3-203ENST00000257899 745 ntTSL 510.45□□□□□ -0.748e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 BLOC1S1-206ENST00000553100 421 ntTSL 28.97□□□□□ -0.978e-20■■■■■ 36.2
PCBP2Q15366 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 36.1
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