Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.688e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 RNF123-207ENST00000457726 4506 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.738e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 RNF123-213ENST00000498376 746 ntTSL 310.38□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-22■■■■□ 22
PCBP1Q15365 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.599e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PHF1-203ENST00000427004 609 ntTSL 416.78■□□□□ 0.281e-10■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 PHF1-206ENST00000459809 461 ntTSL 414.61□□□□□ -0.071e-10■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 PHF1-205ENST00000428274 836 ntTSL 514.59□□□□□ -0.071e-10■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 27.53□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.34e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)5.59□□□□□ -1.519e-20■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 55.04□□□□□ -1.64e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.654e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.654e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.922e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 PPRC1-202ENST00000370012 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 520.97■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 UBE2Z-203ENST00000506271 864 ntTSL 28.71□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 314.03□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 PRSS21-209ENST00000575739 378 ntTSL 39.85□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 21.9
PCBP1Q15365 PCBP2-216ENST00000550192 734 ntTSL 48.63□□□□□ -1.031e-20■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PCBP2-220ENST00000550910 449 ntTSL 36.2□□□□□ -1.421e-20■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 34.23□□□□□ -1.731e-20■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.446e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 229.94■■■□□ 2.388e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 KCTD5-203ENST00000564246 615 ntTSL 329.87■■■□□ 2.376e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.036e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PPP4C-209ENST00000566749 1490 ntTSL 527.3■■□□□ 1.963e-14■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.946e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 KCTD5-205ENST00000570005 486 ntTSL 327.17■■□□□ 1.946e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.873e-14■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.753e-14■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.696e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 525.11■■□□□ 1.614e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 225.11■■□□□ 1.614e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.566e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.566e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.526e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PPP4C-205ENST00000563200 1447 ntTSL 524.22■■□□□ 1.473e-14■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C19orf60-206ENST00000598375 1792 ntTSL 524.15■■□□□ 1.466e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C19orf60-205ENST00000597371 1081 ntTSL 324.07■■□□□ 1.446e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 223.9■■□□□ 1.424e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.396e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 523.46■■□□□ 1.354e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-218ENST00000459667 793 ntTSL 322.99■■□□□ 1.276e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 322.71■■□□□ 1.236e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.26e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-209ENST00000483813 1277 ntTSL 522.39■■□□□ 1.174e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.134e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-207ENST00000527468 571 ntTSL 222.07■■□□□ 1.126e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 421.88■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 521.88■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.096e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 221.64■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C19orf60-207ENST00000600997 2275 ntTSL 221.59■■□□□ 1.056e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 421.38■■□□□ 1.016e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.016e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SGSM3-203ENST00000427834 793 ntTSL 221.31■■□□□ 16e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-220ENST00000461874 845 ntTSL 521.08■□□□□ 0.976e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RTL10-204ENST00000416337 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.01■□□□□ 0.956e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.883e-14■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.846e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.816e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.817e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.786e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-216ENST00000498353 597 ntTSL 319.6■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 IL4I1-208ENST00000601717 2261 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.728e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.718e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CDK4-207ENST00000550419 919 ntTSL 319.4■□□□□ 0.77e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-218ENST00000606525 2010 ntTSL 219.4■□□□□ 0.74e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CDK4-210ENST00000551888 636 ntTSL 219.38■□□□□ 0.697e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-212ENST00000434658 1817 ntTSL 519.28■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 PLXNA3-203ENST00000478236 460 ntTSL 319.27■□□□□ 0.687e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.07■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 C19orf60-208ENST00000601736 491 ntTSL 219.05■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CLASRP-205ENST00000585432 290 ntTSL 219.04■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 419.02■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RECQL4-205ENST00000532846 1055 ntTSL 518.98■□□□□ 0.636e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 518.84■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 IL4I1-206ENST00000596022 747 ntTSL 218.79■□□□□ 0.68e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 518.67■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.576e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 518.43■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NECAB3-204ENST00000463246 766 ntTSL 318.37■□□□□ 0.534e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 518.34■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 FAM3A-222ENST00000621967 1901 ntTSL 218.29■□□□□ 0.526e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.516e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 RIC8A-216ENST00000532373 620 ntTSL 318.13■□□□□ 0.496e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 317.99■□□□□ 0.477e-10■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.468e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.448e-13■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 217.62■□□□□ 0.417e-10■■■■□ 21.8
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