RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566749.5

PPP4C-209, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,490 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-209ENST00000566749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.88■■■■■ 7.18
PPP4C-209ENST00000566749 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.26■■■■■ 6.12
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PPP4C-209ENST00000566749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.19■■■■■ 5.63
PPP4C-209ENST00000566749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.18■■■■■ 5.62
PPP4C-209ENST00000566749 NACADO15069 1562 aa50.1■■■■■ 5.61
PPP4C-209ENST00000566749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.85■■■■■ 5.57
PPP4C-209ENST00000566749 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.74■■■■■ 5.55
PPP4C-209ENST00000566749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.51■■■■■ 5.52
PPP4C-209ENST00000566749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.06■■■■■ 5.44
PPP4C-209ENST00000566749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.83■■■■■ 5.41
PPP4C-209ENST00000566749 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.65■■■■■ 5.38
PPP4C-209ENST00000566749 SCRIBQ14160 1630 aa48.64■■■■■ 5.38
PPP4C-209ENST00000566749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.12■■■■■ 5.29
PPP4C-209ENST00000566749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
PPP4C-209ENST00000566749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
PPP4C-209ENST00000566749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.24■■■■■ 5.15
PPP4C-209ENST00000566749 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.94■■■■■ 5.1
PPP4C-209ENST00000566749 SMARCA4P51532 1647 aa46.49■■■■■ 5.03
PPP4C-209ENST00000566749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.42■■■■■ 5.02
PPP4C-209ENST00000566749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.24■■■■■ 4.99
PPP4C-209ENST00000566749 NCAPD3P42695 1498 aa46.22■■■■■ 4.99
PPP4C-209ENST00000566749 SMARCA2P51531 1590 aa46.2■■■■■ 4.99
PPP4C-209ENST00000566749 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.16■■■■■ 4.98
PPP4C-209ENST00000566749 PEG3Q9GZU2 1588 aa46■■■■■ 4.95
PPP4C-209ENST00000566749 HMGXB3Q12766 1538 aa45.99■■■■■ 4.95
PPP4C-209ENST00000566749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
PPP4C-209ENST00000566749 WIZO95785 1651 aa45.67■■■■■ 4.9
PPP4C-209ENST00000566749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
PPP4C-209ENST00000566749 NESP48681 1621 aa45.18■■■■■ 4.82
PPP4C-209ENST00000566749 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
PPP4C-209ENST00000566749 ERCC6Q03468 1493 aa45.06■■■■■ 4.8
PPP4C-209ENST00000566749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.04■■■■■ 4.8
PPP4C-209ENST00000566749 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.89■■■■■ 4.78
PPP4C-209ENST00000566749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.76■■■■■ 4.76
PPP4C-209ENST00000566749 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.64■■■■■ 4.74
PPP4C-209ENST00000566749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.64■■■■■ 4.74
PPP4C-209ENST00000566749 CFTRP13569 1480 aa44.6■■■■■ 4.73
PPP4C-209ENST00000566749 CUX2O14529 1486 aa44.56■■■■■ 4.72
PPP4C-209ENST00000566749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
PPP4C-209ENST00000566749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
PPP4C-209ENST00000566749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.39■■■■■ 4.7
PPP4C-209ENST00000566749 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.35■■■■■ 4.69
PPP4C-209ENST00000566749 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.29■■■■■ 4.68
PPP4C-209ENST00000566749 PRDM2Q13029 1718 aa44.27■■■■■ 4.68
PPP4C-209ENST00000566749 WDR62O43379 1518 aa44.13■■■■■ 4.65
PPP4C-209ENST00000566749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
PPP4C-209ENST00000566749 TOPBP1Q92547 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
PPP4C-209ENST00000566749 ABCC8Q09428 1581 aa43.66■■■■■ 4.58
PPP4C-209ENST00000566749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.6■■■■■ 4.57
PPP4C-209ENST00000566749 IFT140Q96RY7 1462 aa43.41■■■■■ 4.54
PPP4C-209ENST00000566749 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.31■■■■■ 4.52
PPP4C-209ENST00000566749 CUX1P39880 1505 aa43.3■■■■■ 4.52
PPP4C-209ENST00000566749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
PPP4C-209ENST00000566749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
PPP4C-209ENST00000566749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.18■■■■■ 4.5
PPP4C-209ENST00000566749 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
PPP4C-209ENST00000566749 SOGA1O94964 1423 aa43.13■■■■■ 4.5
PPP4C-209ENST00000566749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.12■■■■■ 4.49
PPP4C-209ENST00000566749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
PPP4C-209ENST00000566749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.48
PPP4C-209ENST00000566749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.99■■■■■ 4.476e-7■■■■□ 24.5
PPP4C-209ENST00000566749 TOP2BQ02880 1626 aa42.91■■■■■ 4.46
PPP4C-209ENST00000566749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
PPP4C-209ENST00000566749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.9■■■■■ 4.46
PPP4C-209ENST00000566749 SYNJ1O43426 1573 aa42.9■■■■■ 4.46
PPP4C-209ENST00000566749 WDR97A6NE52 1622 aa42.82■■■■■ 4.45
PPP4C-209ENST00000566749 OSCARQ8IYS5 282 aa42.74■■■■■ 4.43
PPP4C-209ENST00000566749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.74■■■■■ 4.43
PPP4C-209ENST00000566749 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.63■■■■■ 4.41
PPP4C-209ENST00000566749 GRIN2BQ13224 1484 aa42.62■■■■■ 4.41
PPP4C-209ENST00000566749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.58■■■■■ 4.41
PPP4C-209ENST00000566749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.57■■■■■ 4.41
PPP4C-209ENST00000566749 FBLN2P98095 1184 aa42.55■■■■■ 4.4
PPP4C-209ENST00000566749 CHD1O14646 1710 aa42.54■■■■■ 4.4
PPP4C-209ENST00000566749 PBRM1Q86U86 1689 aa42.54■■■■■ 4.4
PPP4C-209ENST00000566749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
PPP4C-209ENST00000566749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PPP4C-209ENST00000566749 SYNJ2O15056 1496 aa42.36■■■■■ 4.37
PPP4C-209ENST00000566749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
PPP4C-209ENST00000566749 ADAMTS12P58397 1594 aa42.18■■■■■ 4.34
PPP4C-209ENST00000566749 KIF27Q86VH2 1401 aa42.13■■■■■ 4.33
PPP4C-209ENST00000566749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.12■■■■■ 4.33
PPP4C-209ENST00000566749 GRIN2AQ12879 1464 aa42.07■■■■■ 4.33
PPP4C-209ENST00000566749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP4C-209ENST00000566749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP4C-209ENST00000566749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP4C-209ENST00000566749 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP4C-209ENST00000566749 ARHGEF11O15085 1522 aa42.03■■■■■ 4.32
PPP4C-209ENST00000566749 TRIM41Q8WV44 630 aa41.99■■■■■ 4.31
PPP4C-209ENST00000566749 IGF1RP08069 1367 aa41.94■■■■■ 4.31
PPP4C-209ENST00000566749 NUP160Q12769 1436 aa41.87■■■■■ 4.29
PPP4C-209ENST00000566749 CEP170Q5SW79 1584 aa41.86■■■■■ 4.29
PPP4C-209ENST00000566749 CUL7Q14999 1698 aa41.85■■■■■ 4.29
PPP4C-209ENST00000566749 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.71■■■■■ 4.27
PPP4C-209ENST00000566749 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.71■■■■■ 4.27
PPP4C-209ENST00000566749 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.69■■■■■ 4.26
PPP4C-209ENST00000566749 ARAP1Q96P48 1450 aa41.67■■■■■ 4.26
PPP4C-209ENST00000566749 SHROOM2Q13796 1616 aa41.56■■■■■ 4.24
PPP4C-209ENST00000566749 JPH4Q96JJ6 628 aa41.49■■■■■ 4.23
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