Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AUP1Q9Y679 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AUP1Q9Y679 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AUP1Q9Y679 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AUP1Q9Y679 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AUP1Q9Y679 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AUP1Q9Y679 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms