Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 221.32■■□□□ 18e-8■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.458e-8■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 08e-8■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 C20orf27-204ENST00000399683 933 ntTSL 213.14□□□□□ -0.318e-8■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.9□□□□□ -0.823e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.21□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 69.2
RBFOX2O43251 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-20■■■■■ 69.1
RBFOX2O43251 PAPD5-204ENST00000562717 1866 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-20■■■■■ 69.1
RBFOX2O43251 PAPD5-201ENST00000357464 7233 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-20■■■■■ 69.1
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RBFOX2O43251 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 410.1□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 68.5
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RBFOX2O43251 KIFC2-202ENST00000529644 695 ntTSL 313.93□□□□□ -0.189e-15■■■■■ 67.9
RBFOX2O43251 DOCK6-211ENST00000590452 231 ntTSL 38.13□□□□□ -1.117e-10■■■■■ 67.2
RBFOX2O43251 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-12■■■■■ 67.2
RBFOX2O43251 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.5□□□□□ -2.173e-28■■■■■ 67
RBFOX2O43251 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.313e-28■■■■■ 67
RBFOX2O43251 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.729e-14■■■■■ 66.8
RBFOX2O43251 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.879e-14■■■■■ 66.8
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RBFOX2O43251 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 66.4
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RBFOX2O43251 MARS-216ENST00000549048 755 ntTSL 311.98□□□□□ -0.492e-77■■■■■ 65.3
RBFOX2O43251 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 310.68□□□□□ -0.72e-77■■■■■ 65.3
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RBFOX2O43251 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-16■■■■■ 65.3
RBFOX2O43251 NPRL2-204ENST00000433381 1573 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-16■■■■■ 65.3
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RBFOX2O43251 NPRL2-213ENST00000480296 2512 ntTSL 212.1□□□□□ -0.472e-16■■■■■ 65.3
RBFOX2O43251 NPRL2-208ENST00000461020 2229 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.532e-16■■■■■ 65.3
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RBFOX2O43251 NPRL2-209ENST00000467294 3113 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.92e-16■■■■■ 65.3
RBFOX2O43251 NPRL2-207ENST00000451194 1747 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.962e-16■■■■■ 65.3
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RBFOX2O43251 NPRL2-202ENST00000418825 1030 ntTSL 58.73□□□□□ -1.012e-16■■■■■ 65.3
RBFOX2O43251 FTX-204ENST00000430772 708 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 65.2
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RBFOX2O43251 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 64.4
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RBFOX2O43251 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.569e-17■■■■■ 61.9
RBFOX2O43251 CCDC88B-207ENST00000479965 3102 ntTSL 215.91■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 61.5
RBFOX2O43251 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.559e-8■■■■■ 61.2
RBFOX2O43251 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 210.48□□□□□ -0.739e-8■■■■■ 61.2
RBFOX2O43251 GAK-218ENST00000511983 558 ntTSL 49.16□□□□□ -0.949e-8■■■■■ 61.2
RBFOX2O43251 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 61
RBFOX2O43251 PMM2-212ENST00000566604 986 ntTSL 212.35□□□□□ -0.436e-13■■■■■ 60.7
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RBFOX2O43251 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.456e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-203ENST00000562318 931 ntTSL 211.66□□□□□ -0.546e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.776e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.016e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-218ENST00000570134 573 ntTSL 58.66□□□□□ -1.026e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-207ENST00000565221 793 ntTSL 1 (best)8.16□□□□□ -1.16e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-213ENST00000566983 907 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.216e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 PMM2-217ENST00000570076 1002 ntTSL 26.65□□□□□ -1.346e-13■■■■■ 60.7
RBFOX2O43251 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 516.87■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 60.6
RBFOX2O43251 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 310.16□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 60.6
RBFOX2O43251 ALOX12P2-209ENST00000574271 984 ntTSL 315.36■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 60.6
RBFOX2O43251 ALOX12P2-201ENST00000570835 598 ntTSL 413.57□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 60.6
RBFOX2O43251 ALOX12P2-212ENST00000576636 574 ntTSL 410.98□□□□□ -0.657e-7■■■■■ 60.6
RBFOX2O43251 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 513.7□□□□□ -0.224e-17■■■■■ 59.9
RBFOX2O43251 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.484e-17■■■■■ 59.9
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