RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399683.7

C20orf27-204, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf27, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-204ENST00000399683 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.42■■■■□ 3.9
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C20orf27-204ENST00000399683 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
C20orf27-204ENST00000399683 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.72■■■□□ 2.83
C20orf27-204ENST00000399683 NACADO15069 1562 aa32.71■■■□□ 2.83
C20orf27-204ENST00000399683 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.7■■■□□ 2.83
C20orf27-204ENST00000399683 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.65■■■□□ 2.82
C20orf27-204ENST00000399683 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.45■■■□□ 2.79
C20orf27-204ENST00000399683 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.07■■■□□ 2.72
C20orf27-204ENST00000399683 SCRIBQ14160 1630 aa31.86■■■□□ 2.69
C20orf27-204ENST00000399683 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.64■■■□□ 2.66
C20orf27-204ENST00000399683 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.42■■■□□ 2.62
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C20orf27-204ENST00000399683 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
C20orf27-204ENST00000399683 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.57■■■□□ 2.48
C20orf27-204ENST00000399683 SMARCA4P51532 1647 aa30.57■■■□□ 2.48
C20orf27-204ENST00000399683 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
C20orf27-204ENST00000399683 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.51■■■□□ 2.48
C20orf27-204ENST00000399683 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.36■■■□□ 2.45
C20orf27-204ENST00000399683 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.29■■■□□ 2.44
C20orf27-204ENST00000399683 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.28■■■□□ 2.44
C20orf27-204ENST00000399683 SMARCA2P51531 1590 aa30.25■■■□□ 2.43
C20orf27-204ENST00000399683 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.18■■■□□ 2.42
C20orf27-204ENST00000399683 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
C20orf27-204ENST00000399683 WIZO95785 1651 aa30.11■■■□□ 2.41
C20orf27-204ENST00000399683 HMGXB3Q12766 1538 aa30.11■■■□□ 2.41
C20orf27-204ENST00000399683 NCAPD3P42695 1498 aa30.1■■■□□ 2.41
C20orf27-204ENST00000399683 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
C20orf27-204ENST00000399683 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
C20orf27-204ENST00000399683 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
C20orf27-204ENST00000399683 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.38■■■□□ 2.29
C20orf27-204ENST00000399683 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.33■■■□□ 2.29
C20orf27-204ENST00000399683 PRDM2Q13029 1718 aa29.29■■■□□ 2.28
C20orf27-204ENST00000399683 NESP48681 1621 aa29.2■■■□□ 2.27
C20orf27-204ENST00000399683 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.19■■■□□ 2.26
C20orf27-204ENST00000399683 CFTRP13569 1480 aa29.17■■■□□ 2.26
C20orf27-204ENST00000399683 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.06■■■□□ 2.24
C20orf27-204ENST00000399683 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29■■■□□ 2.23
C20orf27-204ENST00000399683 ERCC6Q03468 1493 aa28.93■■■□□ 2.22
C20orf27-204ENST00000399683 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.9■■■□□ 2.22
C20orf27-204ENST00000399683 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.86■■■□□ 2.21
C20orf27-204ENST00000399683 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
C20orf27-204ENST00000399683 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.72■■■□□ 2.19
C20orf27-204ENST00000399683 WDR62O43379 1518 aa28.68■■■□□ 2.18
C20orf27-204ENST00000399683 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
C20orf27-204ENST00000399683 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.59■■■□□ 2.17
C20orf27-204ENST00000399683 ABCC8Q09428 1581 aa28.57■■■□□ 2.16
C20orf27-204ENST00000399683 CUX2O14529 1486 aa28.54■■■□□ 2.16
C20orf27-204ENST00000399683 TOPBP1Q92547 1522 aa28.52■■■□□ 2.16
C20orf27-204ENST00000399683 CUX1P39880 1505 aa28.48■■■□□ 2.15
C20orf27-204ENST00000399683 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.47■■■□□ 2.15
C20orf27-204ENST00000399683 TOP2BQ02880 1626 aa28.42■■■□□ 2.14
C20orf27-204ENST00000399683 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
C20orf27-204ENST00000399683 SYNJ1O43426 1573 aa28.41■■■□□ 2.14
C20orf27-204ENST00000399683 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
C20orf27-204ENST00000399683 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.29■■■□□ 2.12
C20orf27-204ENST00000399683 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
C20orf27-204ENST00000399683 WDR97A6NE52 1622 aa28.23■■■□□ 2.11
C20orf27-204ENST00000399683 IFT140Q96RY7 1462 aa28.22■■■□□ 2.11
C20orf27-204ENST00000399683 SOGA1O94964 1423 aa28.11■■■□□ 2.09
C20orf27-204ENST00000399683 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.1■■■□□ 2.09
C20orf27-204ENST00000399683 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.07■■■□□ 2.08
C20orf27-204ENST00000399683 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
C20orf27-204ENST00000399683 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.01■■■□□ 2.07
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
C20orf27-204ENST00000399683 PBRM1Q86U86 1689 aa27.96■■■□□ 2.07
C20orf27-204ENST00000399683 TRIM41Q8WV44 630 aa27.91■■■□□ 2.06
C20orf27-204ENST00000399683 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.87■■■□□ 2.05
C20orf27-204ENST00000399683 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.052e-6■■■■■ 26.9
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C20orf27-204ENST00000399683 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.85■■■□□ 2.05
C20orf27-204ENST00000399683 GRIN2BQ13224 1484 aa27.8■■■□□ 2.04
C20orf27-204ENST00000399683 KIF27Q86VH2 1401 aa27.78■■■□□ 2.04
C20orf27-204ENST00000399683 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.77■■■□□ 2.04
C20orf27-204ENST00000399683 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
C20orf27-204ENST00000399683 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.7■■■□□ 2.02
C20orf27-204ENST00000399683 ADAMTS12P58397 1594 aa27.69■■■□□ 2.02
C20orf27-204ENST00000399683 CUL7Q14999 1698 aa27.69■■■□□ 2.02
C20orf27-204ENST00000399683 CHD1O14646 1710 aa27.68■■■□□ 2.02
C20orf27-204ENST00000399683 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.62■■■□□ 2.01
C20orf27-204ENST00000399683 EEA1Q15075 1411 aa27.59■■■□□ 2.01
C20orf27-204ENST00000399683 SYNJ2O15056 1496 aa27.58■■■□□ 2.01
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C20orf27-204ENST00000399683 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.54■■■□□ 2
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C20orf27-204ENST00000399683 PRXQ9BXM0 1461 aa27.38■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 KIF21BO75037 1637 aa27.37■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.36■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 CEP170Q5SW79 1584 aa27.35■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.34■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 FBLN2P98095 1184 aa27.33■■□□□ 1.97
C20orf27-204ENST00000399683 NUP160Q12769 1436 aa27.32■■□□□ 1.96
C20orf27-204ENST00000399683 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.31■■□□□ 1.96
C20orf27-204ENST00000399683 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.3■■□□□ 1.96
C20orf27-204ENST00000399683 OSCARQ8IYS5 282 aa27.26■■□□□ 1.95
C20orf27-204ENST00000399683 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
C20orf27-204ENST00000399683 SHROOM2Q13796 1616 aa27.18■■□□□ 1.94
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