RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549048.1

MARS-216, Transcript of methionyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene MARS, Length 755 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARS-216ENST00000549048 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.27■■■■□ 3.88
MARS-216ENST00000549048 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.35■■■■□ 3.25
MARS-216ENST00000549048 ABCC9O60706 1549 aa35.02■■■■□ 3.2
MARS-216ENST00000549048 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.53■■■□□ 2.96
MARS-216ENST00000549048 NACADO15069 1562 aa33.36■■■□□ 2.93
MARS-216ENST00000549048 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.06■■■□□ 2.88
MARS-216ENST00000549048 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.82■■■□□ 2.84
MARS-216ENST00000549048 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.79■■■□□ 2.84
MARS-216ENST00000549048 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.7■■■□□ 2.83
MARS-216ENST00000549048 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.61■■■□□ 2.81
MARS-216ENST00000549048 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
MARS-216ENST00000549048 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.58■■■□□ 2.81
MARS-216ENST00000549048 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.5■■■□□ 2.79
MARS-216ENST00000549048 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.32■■■□□ 2.76
MARS-216ENST00000549048 SCRIBQ14160 1630 aa31.97■■■□□ 2.71
MARS-216ENST00000549048 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.76■■■□□ 2.67
MARS-216ENST00000549048 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
MARS-216ENST00000549048 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.63■■■□□ 2.65
MARS-216ENST00000549048 NCAPD3P42695 1498 aa30.79■■■□□ 2.52
MARS-216ENST00000549048 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.63■■■□□ 2.49
MARS-216ENST00000549048 SMARCA4P51532 1647 aa30.62■■■□□ 2.49
MARS-216ENST00000549048 HMGXB3Q12766 1538 aa30.6■■■□□ 2.49
MARS-216ENST00000549048 SMARCA2P51531 1590 aa30.59■■■□□ 2.49
MARS-216ENST00000549048 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
MARS-216ENST00000549048 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.46■■■□□ 2.47
MARS-216ENST00000549048 CUX2O14529 1486 aa30.37■■■□□ 2.45
MARS-216ENST00000549048 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
MARS-216ENST00000549048 ERCC6Q03468 1493 aa30.25■■■□□ 2.43
MARS-216ENST00000549048 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.21■■■□□ 2.43
MARS-216ENST00000549048 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.2■■■□□ 2.42
MARS-216ENST00000549048 NESP48681 1621 aa30.11■■■□□ 2.41
MARS-216ENST00000549048 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.08■■■□□ 2.41
MARS-216ENST00000549048 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
MARS-216ENST00000549048 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.84■■■□□ 2.37
MARS-216ENST00000549048 WIZO95785 1651 aa29.81■■■□□ 2.36
MARS-216ENST00000549048 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.81■■■□□ 2.36
MARS-216ENST00000549048 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.77■■■□□ 2.36
MARS-216ENST00000549048 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
MARS-216ENST00000549048 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.58■■■□□ 2.33
MARS-216ENST00000549048 WDR62O43379 1518 aa29.57■■■□□ 2.32
MARS-216ENST00000549048 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MARS-216ENST00000549048 CFTRP13569 1480 aa29.5■■■□□ 2.31
MARS-216ENST00000549048 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.45■■■□□ 2.31
MARS-216ENST00000549048 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.41■■■□□ 2.3
MARS-216ENST00000549048 PRDM2Q13029 1718 aa29.28■■■□□ 2.28
MARS-216ENST00000549048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
MARS-216ENST00000549048 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.11■■■□□ 2.25
MARS-216ENST00000549048 ABCC8Q09428 1581 aa28.9■■■□□ 2.22
MARS-216ENST00000549048 IFT140Q96RY7 1462 aa28.9■■■□□ 2.22
MARS-216ENST00000549048 TOPBP1Q92547 1522 aa28.88■■■□□ 2.21
MARS-216ENST00000549048 OSCARQ8IYS5 282 aa28.82■■■□□ 2.2
MARS-216ENST00000549048 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.81■■■□□ 2.2
MARS-216ENST00000549048 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
MARS-216ENST00000549048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
MARS-216ENST00000549048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
MARS-216ENST00000549048 TRIM41Q8WV44 630 aa28.63■■■□□ 2.17
MARS-216ENST00000549048 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
MARS-216ENST00000549048 WDR97A6NE52 1622 aa28.52■■■□□ 2.16
MARS-216ENST00000549048 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.52■■■□□ 2.16
MARS-216ENST00000549048 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.52■■■□□ 2.16
MARS-216ENST00000549048 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.52■■■□□ 2.16
MARS-216ENST00000549048 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.154e-7■■■■□ 19.7
MARS-216ENST00000549048 ARHGEF11O15085 1522 aa28.44■■■□□ 2.14
MARS-216ENST00000549048 CHD1O14646 1710 aa28.43■■■□□ 2.14
MARS-216ENST00000549048 SOGA1O94964 1423 aa28.39■■■□□ 2.14
MARS-216ENST00000549048 CUX1P39880 1505 aa28.38■■■□□ 2.13
MARS-216ENST00000549048 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.38■■■□□ 2.13
MARS-216ENST00000549048 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.37■■■□□ 2.13
MARS-216ENST00000549048 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
MARS-216ENST00000549048 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
MARS-216ENST00000549048 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.22■■■□□ 2.11
MARS-216ENST00000549048 GRIN2BQ13224 1484 aa28.21■■■□□ 2.11
MARS-216ENST00000549048 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.19■■■□□ 2.1
MARS-216ENST00000549048 ARAP1Q96P48 1450 aa28.16■■■□□ 2.1
MARS-216ENST00000549048 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.14■■■□□ 2.1
MARS-216ENST00000549048 SYNJ2O15056 1496 aa28.13■■■□□ 2.09
MARS-216ENST00000549048 SYNJ1O43426 1573 aa28.12■■■□□ 2.09
MARS-216ENST00000549048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.11■■■□□ 2.09
MARS-216ENST00000549048 PBRM1Q86U86 1689 aa28.11■■■□□ 2.09
MARS-216ENST00000549048 FBLN2P98095 1184 aa28.1■■■□□ 2.09
MARS-216ENST00000549048 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.08■■■□□ 2.09
MARS-216ENST00000549048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.04■■■□□ 2.08
MARS-216ENST00000549048 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
MARS-216ENST00000549048 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.02■■■□□ 2.08
MARS-216ENST00000549048 TOP2BQ02880 1626 aa28■■■□□ 2.07
MARS-216ENST00000549048 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MARS-216ENST00000549048 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
MARS-216ENST00000549048 ADAMTS12P58397 1594 aa27.86■■■□□ 2.05
MARS-216ENST00000549048 GRIN2AQ12879 1464 aa27.85■■■□□ 2.05
MARS-216ENST00000549048 NUP160Q12769 1436 aa27.82■■■□□ 2.04
MARS-216ENST00000549048 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.82■■■□□ 2.04
MARS-216ENST00000549048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.76■■■□□ 2.04
MARS-216ENST00000549048 CEP170Q5SW79 1584 aa27.73■■■□□ 2.03
MARS-216ENST00000549048 SHROOM2Q13796 1616 aa27.73■■■□□ 2.03
MARS-216ENST00000549048 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
MARS-216ENST00000549048 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.62■■■□□ 2.01
MARS-216ENST00000549048 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.48■■□□□ 1.99
MARS-216ENST00000549048 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
MARS-216ENST00000549048 CUL7Q14999 1698 aa27.4■■□□□ 1.98
MARS-216ENST00000549048 KIF27Q86VH2 1401 aa27.37■■□□□ 1.97
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