RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217195.12

C20orf27-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf27, Length 1,302 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-201ENST00000217195 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.25■■■■■ 5.32
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.16■■■■■ 4.5
C20orf27-201ENST00000217195 ABCC9O60706 1549 aa42.54■■■■■ 4.4
C20orf27-201ENST00000217195 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.87■■■■■ 4.13
C20orf27-201ENST00000217195 NACADO15069 1562 aa40.72■■■■■ 4.11
C20orf27-201ENST00000217195 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.43■■■■■ 4.06
C20orf27-201ENST00000217195 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.39■■■■■ 4.06
C20orf27-201ENST00000217195 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
C20orf27-201ENST00000217195 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.01■■■■■ 4
C20orf27-201ENST00000217195 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.72■■■■□ 3.95
C20orf27-201ENST00000217195 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
C20orf27-201ENST00000217195 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.49■■■■□ 3.91
C20orf27-201ENST00000217195 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.38■■■■□ 3.89
C20orf27-201ENST00000217195 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.34■■■■□ 3.89
C20orf27-201ENST00000217195 SCRIBQ14160 1630 aa39.21■■■■□ 3.87
C20orf27-201ENST00000217195 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
C20orf27-201ENST00000217195 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.49■■■■□ 3.75
C20orf27-201ENST00000217195 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.35■■■■□ 3.73
C20orf27-201ENST00000217195 NCAPD3P42695 1498 aa37.56■■■■□ 3.6
C20orf27-201ENST00000217195 SMARCA4P51532 1647 aa37.52■■■■□ 3.6
C20orf27-201ENST00000217195 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
C20orf27-201ENST00000217195 SMARCA2P51531 1590 aa37.47■■■■□ 3.59
C20orf27-201ENST00000217195 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.46■■■■□ 3.59
C20orf27-201ENST00000217195 HMGXB3Q12766 1538 aa37.35■■■■□ 3.57
C20orf27-201ENST00000217195 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.23■■■■□ 3.55
C20orf27-201ENST00000217195 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
C20orf27-201ENST00000217195 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.09■■■■□ 3.53
C20orf27-201ENST00000217195 ERCC6Q03468 1493 aa36.82■■■■□ 3.49
C20orf27-201ENST00000217195 CUX2O14529 1486 aa36.66■■■■□ 3.46
C20orf27-201ENST00000217195 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.65■■■■□ 3.46
C20orf27-201ENST00000217195 WIZO95785 1651 aa36.64■■■■□ 3.46
C20orf27-201ENST00000217195 NESP48681 1621 aa36.63■■■■□ 3.45
C20orf27-201ENST00000217195 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
C20orf27-201ENST00000217195 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.46■■■■□ 3.43
C20orf27-201ENST00000217195 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.43■■■■□ 3.42
C20orf27-201ENST00000217195 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
C20orf27-201ENST00000217195 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
C20orf27-201ENST00000217195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.2■■■■□ 3.39
C20orf27-201ENST00000217195 CFTRP13569 1480 aa36.11■■■■□ 3.37
C20orf27-201ENST00000217195 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.05■■■■□ 3.36
C20orf27-201ENST00000217195 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.02■■■■□ 3.36
C20orf27-201ENST00000217195 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36■■■■□ 3.35
C20orf27-201ENST00000217195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.98■■■■□ 3.35
C20orf27-201ENST00000217195 WDR62O43379 1518 aa35.94■■■■□ 3.34
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.87■■■■□ 3.33
C20orf27-201ENST00000217195 PRDM2Q13029 1718 aa35.74■■■■□ 3.31
C20orf27-201ENST00000217195 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
C20orf27-201ENST00000217195 ABCC8Q09428 1581 aa35.46■■■■□ 3.27
C20orf27-201ENST00000217195 TOPBP1Q92547 1522 aa35.33■■■■□ 3.25
C20orf27-201ENST00000217195 IFT140Q96RY7 1462 aa35.31■■■■□ 3.24
C20orf27-201ENST00000217195 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.28■■■■□ 3.24
C20orf27-201ENST00000217195 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
C20orf27-201ENST00000217195 OSCARQ8IYS5 282 aa35.03■■■■□ 3.2
C20orf27-201ENST00000217195 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
C20orf27-201ENST00000217195 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
C20orf27-201ENST00000217195 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
C20orf27-201ENST00000217195 SOGA1O94964 1423 aa34.88■■■■□ 3.17
C20orf27-201ENST00000217195 CUX1P39880 1505 aa34.84■■■■□ 3.17
C20orf27-201ENST00000217195 WDR97A6NE52 1622 aa34.84■■■■□ 3.17
C20orf27-201ENST00000217195 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
C20orf27-201ENST00000217195 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.8■■■■□ 3.168e-7■■■■■ 33.8
C20orf27-201ENST00000217195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.79■■■■□ 3.16
C20orf27-201ENST00000217195 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
C20orf27-201ENST00000217195 GRIN2BQ13224 1484 aa34.57■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 TRIM41Q8WV44 630 aa34.54■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.53■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 CHD1O14646 1710 aa34.52■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 FBLN2P98095 1184 aa34.52■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.51■■■■□ 3.12
C20orf27-201ENST00000217195 TOP2BQ02880 1626 aa34.49■■■■□ 3.11
C20orf27-201ENST00000217195 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.48■■■■□ 3.11
C20orf27-201ENST00000217195 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.47■■■■□ 3.11
C20orf27-201ENST00000217195 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
C20orf27-201ENST00000217195 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.4■■■■□ 3.1
C20orf27-201ENST00000217195 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.4■■■■□ 3.1
C20orf27-201ENST00000217195 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.4■■■■□ 3.1
C20orf27-201ENST00000217195 SYNJ2O15056 1496 aa34.39■■■■□ 3.1
C20orf27-201ENST00000217195 ARHGEF11O15085 1522 aa34.39■■■■□ 3.1
C20orf27-201ENST00000217195 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.38■■■■□ 3.09
C20orf27-201ENST00000217195 SYNJ1O43426 1573 aa34.37■■■■□ 3.09
C20orf27-201ENST00000217195 PBRM1Q86U86 1689 aa34.35■■■■□ 3.09
C20orf27-201ENST00000217195 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.22■■■■□ 3.07
C20orf27-201ENST00000217195 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.14■■■■□ 3.06
C20orf27-201ENST00000217195 ADAMTS12P58397 1594 aa34.1■■■■□ 3.05
C20orf27-201ENST00000217195 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.09■■■■□ 3.05
C20orf27-201ENST00000217195 GRIN2AQ12879 1464 aa34.09■■■■□ 3.05
C20orf27-201ENST00000217195 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.08■■■■□ 3.05
C20orf27-201ENST00000217195 ARAP1Q96P48 1450 aa34.05■■■■□ 3.04
C20orf27-201ENST00000217195 NUP160Q12769 1436 aa33.97■■■■□ 3.03
C20orf27-201ENST00000217195 KIF27Q86VH2 1401 aa33.9■■■■□ 3.02
C20orf27-201ENST00000217195 CEP170Q5SW79 1584 aa33.86■■■■□ 3.01
C20orf27-201ENST00000217195 CUL7Q14999 1698 aa33.74■■■□□ 2.99
C20orf27-201ENST00000217195 IGF1RP08069 1367 aa33.74■■■□□ 2.99
C20orf27-201ENST00000217195 SHROOM2Q13796 1616 aa33.73■■■□□ 2.99
C20orf27-201ENST00000217195 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.6■■■□□ 2.97
C20orf27-201ENST00000217195 JPH4Q96JJ6 628 aa33.6■■■□□ 2.97
C20orf27-201ENST00000217195 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms