Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 DDX24-202ENST00000544005 2214 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.657e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.37e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.538e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.965e-9■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.895e-9■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)16.82■□□□□ 0.285e-9■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 EIF4G1-238ENST00000493299 559 ntTSL 413.68□□□□□ -0.225e-8■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 218.86■□□□□ 0.617e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 SF3B3-214ENST00000572365 575 ntTSL 48.38□□□□□ -1.078e-7■■■■□ 22.3
FMR1Q06787 RPL13A-209ENST00000479992 850 ntTSL 319.65■□□□□ 0.742e-18■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 CTNND1-238ENST00000534647 866 ntTSL 515.06■□□□□ 02e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 LTBP4-223ENST00000598717 811 ntTSL 522.68■■□□□ 1.226e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 322.57■■□□□ 1.21e-10■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 SDHA-211ENST00000509564 630 ntTSL 315.17■□□□□ 0.021e-10■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 SDHA-208ENST00000507522 644 ntTSL 515.06■□□□□ 01e-10■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 AKAP8L-217ENST00000600065 679 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-10■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 AKAP8L-206ENST00000595087 796 ntTSL 29.44□□□□□ -0.91e-10■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 COPA-203ENST00000481040 578 ntTSL 38.07□□□□□ -1.121e-10■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.237e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.899e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.029e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.719e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.369e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 LTBP4-219ENST00000598055 568 ntTSL 414.94□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.487e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.499e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 217.61■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 MCM4-204ENST00000518382 366 ntTSL 36.96□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 MCM3AP-204ENST00000467026 2671 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 ZDHHC7-202ENST00000344861 2727 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.647e-12■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.17e-12■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 516.29■□□□□ 0.23e-8■■■■□ 22.2
FMR1Q06787 HNRNPUL1-215ENST00000600332 644 ntTSL 311.17□□□□□ -0.622e-8■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 BRD7-203ENST00000401491 1338 ntTSL 534.85■■■■□ 3.172e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 BRD7-206ENST00000567826 740 ntTSL 534.68■■■■□ 3.142e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 LRRFIP1-205ENST00000420665 570 ntTSL 329.75■■■□□ 2.353e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 UNC45A-204ENST00000471780 1730 ntTSL 521.92■■□□□ 1.13e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 LRRFIP1-215ENST00000498053 593 ntTSL 321.65■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 PKP4-214ENST00000492496 796 ntTSL 319.84■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.515e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 SHMT2-217ENST00000555116 1885 ntTSL 217.47■□□□□ 0.392e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.373e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.337e-8■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 SHMT2-222ENST00000555774 2311 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.062e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-8■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.012e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-8■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 KRT18-204ENST00000548015 928 ntTSL 214.31□□□□□ -0.122e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 BRD7-201ENST00000394688 5370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.545e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.742e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 HUWE1-209ENST00000474288 1254 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.775e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 GTF3C1-203ENST00000562609 2824 ntTSL 515.71■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 METTL13-207ENST00000485629 759 ntTSL 522.25■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 TRIM28-203ENST00000593582 533 ntTSL 319.21■□□□□ 0.676e-11■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.42e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.884e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.399e-7■■■■□ 22.1
FMR1Q06787 CYFIP1-211ENST00000619348 3471 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 08e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 CYFIP1-202ENST00000561263 707 ntTSL 210.83□□□□□ -0.688e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22
FMR1Q06787 FLNA-215ENST00000474358 696 ntTSL 222.46■■□□□ 1.191e-19■■■■□ 22
FMR1Q06787 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 EIF4G1-217ENST00000428387 524 ntTSL 412.89□□□□□ -0.355e-8■■■■□ 22
FMR1Q06787 EIF4G1-215ENST00000427607 596 ntTSL 212.45□□□□□ -0.425e-8■■■■□ 22
FMR1Q06787 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.147e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.097e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 AP2A1-207ENST00000600466 2903 ntTSL 219.47■□□□□ 0.717e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 HYOU1-203ENST00000527038 629 ntTSL 227.56■■■□□ 26e-11■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-215ENST00000496553 888 ntTSL 226.93■■□□□ 1.91e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-204ENST00000467295 1060 ntTSL 326.93■■□□□ 1.91e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-214ENST00000496133 815 ntTSL 525.97■■□□□ 1.751e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-207ENST00000475570 506 ntTSL 224.79■■□□□ 1.561e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-209ENST00000479948 681 ntTSL 324.71■■□□□ 1.551e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-7■■■■□ 22
FMR1Q06787 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-7■■■■□ 22
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 94.1 ms