RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.81■■■■□ 3.48
PKP3-201ENST00000331563 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.52■■■□□ 2.64
PKP3-201ENST00000331563 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.23■■■□□ 2.59
PKP3-201ENST00000331563 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.16■■■□□ 2.58
PKP3-201ENST00000331563 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
PKP3-201ENST00000331563 HRCP23327 699 aa30.46■■■□□ 2.47
PKP3-201ENST00000331563 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
PKP3-201ENST00000331563 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
PKP3-201ENST00000331563 ABCC9O60706 1549 aa30.17■■■□□ 2.42
PKP3-201ENST00000331563 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.03■■■□□ 2.4
PKP3-201ENST00000331563 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.93■■■□□ 2.38
PKP3-201ENST00000331563 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
PKP3-201ENST00000331563 SCRIBQ14160 1630 aa29.63■■■□□ 2.33
PKP3-201ENST00000331563 MYT1Q01538 1121 aa29.54■■■□□ 2.32
PKP3-201ENST00000331563 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.52■■■□□ 2.32
PKP3-201ENST00000331563 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.42■■■□□ 2.3
PKP3-201ENST00000331563 NACADO15069 1562 aa29.38■■■□□ 2.29
PKP3-201ENST00000331563 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.12■■■□□ 2.25
PKP3-201ENST00000331563 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PKP3-201ENST00000331563 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PKP3-201ENST00000331563 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.91■■■□□ 2.22
PKP3-201ENST00000331563 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
PKP3-201ENST00000331563 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.84■■■□□ 2.21
PKP3-201ENST00000331563 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.2
PKP3-201ENST00000331563 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.74■■■□□ 2.19
PKP3-201ENST00000331563 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.67■■■□□ 2.18
PKP3-201ENST00000331563 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PKP3-201ENST00000331563 WIZO95785 1651 aa28.48■■■□□ 2.15
PKP3-201ENST00000331563 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.39■■■□□ 2.14
PKP3-201ENST00000331563 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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PKP3-201ENST00000331563 TRIM41Q8WV44 630 aa28.15■■■□□ 2.1
PKP3-201ENST00000331563 NEUROD1Q13562 356 aa28.08■■■□□ 2.09
PKP3-201ENST00000331563 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PKP3-201ENST00000331563 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28■■■□□ 2.07
PKP3-201ENST00000331563 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28■■■□□ 2.07
PKP3-201ENST00000331563 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PKP3-201ENST00000331563 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PKP3-201ENST00000331563 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PKP3-201ENST00000331563 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.88■■■□□ 2.05
PKP3-201ENST00000331563 SMARCA2P51531 1590 aa27.77■■■□□ 2.04
PKP3-201ENST00000331563 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PKP3-201ENST00000331563 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
PKP3-201ENST00000331563 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PKP3-201ENST00000331563 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.66■■■□□ 2.02
PKP3-201ENST00000331563 ABCC8Q09428 1581 aa27.65■■■□□ 2.02
PKP3-201ENST00000331563 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
PKP3-201ENST00000331563 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.56■■■□□ 2
PKP3-201ENST00000331563 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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PKP3-201ENST00000331563 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
PKP3-201ENST00000331563 SOGA1O94964 1423 aa27.27■■□□□ 1.96
PKP3-201ENST00000331563 NCAPD3P42695 1498 aa27.22■■□□□ 1.95
PKP3-201ENST00000331563 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.21■■□□□ 1.95
PKP3-201ENST00000331563 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
PKP3-201ENST00000331563 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
PKP3-201ENST00000331563 HMGXB3Q12766 1538 aa27.1■■□□□ 1.93
PKP3-201ENST00000331563 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.08■■□□□ 1.93
PKP3-201ENST00000331563 SYNJ1O43426 1573 aa27.08■■□□□ 1.93
PKP3-201ENST00000331563 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.03■■□□□ 1.92
PKP3-201ENST00000331563 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PKP3-201ENST00000331563 MIER1Q8N108 512 aa26.95■■□□□ 1.9
PKP3-201ENST00000331563 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.94■■□□□ 1.9
PKP3-201ENST00000331563 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PKP3-201ENST00000331563 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.87■■□□□ 1.89
PKP3-201ENST00000331563 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PKP3-201ENST00000331563 CFTRP13569 1480 aa26.8■■□□□ 1.88
PKP3-201ENST00000331563 EEA1Q15075 1411 aa26.75■■□□□ 1.87
PKP3-201ENST00000331563 CEP162Q5TB80 1403 aa26.73■■□□□ 1.87
PKP3-201ENST00000331563 TOP2BQ02880 1626 aa26.72■■□□□ 1.87
PKP3-201ENST00000331563 CUX1P39880 1505 aa26.71■■□□□ 1.87
PKP3-201ENST00000331563 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.7■■□□□ 1.86
PKP3-201ENST00000331563 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.67■■□□□ 1.86
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA3Q08378 1498 aa26.64■■□□□ 1.85
PKP3-201ENST00000331563 NESP48681 1621 aa26.63■■□□□ 1.85
PKP3-201ENST00000331563 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.6■■□□□ 1.85
PKP3-201ENST00000331563 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.58■■□□□ 1.85
PKP3-201ENST00000331563 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PKP3-201ENST00000331563 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.55■■□□□ 1.84
PKP3-201ENST00000331563 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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PKP3-201ENST00000331563 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.46■■□□□ 1.83
PKP3-201ENST00000331563 PRDM2Q13029 1718 aa26.45■■□□□ 1.83
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PKP3-201ENST00000331563 KIF21BO75037 1637 aa26.43■■□□□ 1.82
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PKP3-201ENST00000331563 KIF27Q86VH2 1401 aa26.39■■□□□ 1.82
PKP3-201ENST00000331563 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.38■■□□□ 1.81
PKP3-201ENST00000331563 CUX2O14529 1486 aa26.36■■□□□ 1.81
PKP3-201ENST00000331563 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.36■■□□□ 1.81
PKP3-201ENST00000331563 PRXQ9BXM0 1461 aa26.31■■□□□ 1.8
PKP3-201ENST00000331563 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.28■■□□□ 1.8
PKP3-201ENST00000331563 IGF1RP08069 1367 aa26.24■■□□□ 1.79
PKP3-201ENST00000331563 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.17■■□□□ 1.78
PKP3-201ENST00000331563 TOPBP1Q92547 1522 aa26.17■■□□□ 1.78
PKP3-201ENST00000331563 BCANQ96GW7 911 aa26.15■■□□□ 1.78
PKP3-201ENST00000331563 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.13■■□□□ 1.77
PKP3-201ENST00000331563 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.12■■□□□ 1.77
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