Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.973e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 REV1-203ENST00000413697 4727 ntTSL 225.79■■□□□ 1.723e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 538.19■■■■□ 3.72e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-208ENST00000518892 399 ntTSL 333.51■■■□□ 2.952e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 528.7■■■□□ 2.182e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 520.66■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 411.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 53.94□□□□□ -1.782e-8■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)26.11■■□□□ 1.772e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 CHD4-214ENST00000545942 1317 ntTSL 1 (best)36.31■■■■□ 3.43e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 CHD4-213ENST00000545584 553 ntTSL 431.67■■■□□ 2.663e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 RPRD1B-203ENST00000462548 2436 ntTSL 522.27■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 RPRD1B-202ENST00000449186 591 ntTSL 417.19■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 AKAP13-216ENST00000560256 322 ntTSL 35.12□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ACTN1-209ENST00000553659 434 ntTSL 425.43■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ACTN1-221ENST00000556571 568 ntTSL 419.37■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ACTN1-208ENST00000553370 605 ntTSL 315.89■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.534e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.954e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-207ENST00000539204 649 ntTSL 319.93■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-216ENST00000544622 685 ntTSL 318.06■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-213ENST00000542641 669 ntTSL 417.74■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-218ENST00000546298 564 ntTSL 414.89□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-208ENST00000540447 6393 ntTSL 29.88□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 YBX3-214ENST00000544501 181 ntTSL 22.87□□□□□ -1.954e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 230.17■■■□□ 2.428e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 DGCR2-207ENST00000608548 518 ntTSL 219.72■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 LCOR-208ENST00000493486 245 ntTSL 35.6□□□□□ -1.515e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ERI3-205ENST00000457571 975 ntTSL 539.34■■■■□ 3.894e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ERI3-209ENST00000495828 972 ntTSL 335.91■■■■□ 3.344e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 334.7■■■■□ 3.154e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.014e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 PAN3-203ENST00000483842 729 ntTSL 39.75□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 PRIM2-205ENST00000490313 410 ntTSL 38.76□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.793e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 CDK17-202ENST00000542666 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 239.61■■■■□ 3.934e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 338.2■■■■□ 3.719e-8■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.244e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.889e-8■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.774e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.249e-8■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 27.2
HNRNPMP52272 LRBA-211ENST00000513021 568 ntTSL 414.04□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 512.21□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SNX9-202ENST00000614703 542 ntTSL 415.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SNX9-203ENST00000614800 553 ntTSL 49.61□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 DGCR2-203ENST00000467659 2459 ntTSL 523.88■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.195e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 BRWD1-214ENST00000484090 429 ntTSL 236.08■■■■□ 3.375e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.625e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.625e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-219ENST00000545574 878 ntTSL 530.35■■■□□ 2.455e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.315e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 528.92■■■□□ 2.225e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-203ENST00000396637 1508 ntTSL 527.84■■■□□ 2.055e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 TCERG1-207ENST00000507175 1984 ntTSL 227.1■■□□□ 1.935e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.845e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.725e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 225.42■■□□□ 1.665e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-208ENST00000450385 815 ntTSL 325.39■■□□□ 1.665e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-215ENST00000542539 848 ntTSL 525.08■■□□□ 1.615e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-218ENST00000545220 553 ntTSL 424.2■■□□□ 1.465e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.395e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 ERN1-207ENST00000584041 566 ntTSL 423.65■■□□□ 1.385e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.25e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.095e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.085e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-211ENST00000537873 522 ntTSL 420.95■□□□□ 0.945e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-203ENST00000425444 597 ntTSL 320.31■□□□□ 0.845e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.755e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.745e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 519.25■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-210ENST00000536883 575 ntTSL 418.76■□□□□ 0.595e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-216ENST00000543974 548 ntTSL 518.49■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 PEX5-212ENST00000539304 708 ntTSL 218.37■□□□□ 0.535e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.435e-8■■■■■ 27.1
HNRNPMP52272 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 317.49■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 27.1
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 167.4 ms