RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.57■■□□□ 1.84
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.48■■□□□ 1.35
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC9O60706 1549 aa23■■□□□ 1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.24■■□□□ 1.15
RPRD1B-202ENST00000449186 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RPRD1B-202ENST00000449186 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.05■■□□□ 1.12
RPRD1B-202ENST00000449186 NACADO15069 1562 aa22.04■■□□□ 1.12
RPRD1B-202ENST00000449186 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.89■■□□□ 1.09
RPRD1B-202ENST00000449186 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.89■■□□□ 1.09
RPRD1B-202ENST00000449186 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.68■■□□□ 1.06
RPRD1B-202ENST00000449186 SCRIBQ14160 1630 aa21.58■■□□□ 1.05
RPRD1B-202ENST00000449186 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
RPRD1B-202ENST00000449186 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.48■■□□□ 1.03
RPRD1B-202ENST00000449186 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.24■□□□□ 0.99
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.06■□□□□ 0.96
RPRD1B-202ENST00000449186 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RPRD1B-202ENST00000449186 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.79■□□□□ 0.92
RPRD1B-202ENST00000449186 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.77■□□□□ 0.92
RPRD1B-202ENST00000449186 SMARCA4P51532 1647 aa20.6■□□□□ 0.89
RPRD1B-202ENST00000449186 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.55■□□□□ 0.88
RPRD1B-202ENST00000449186 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
RPRD1B-202ENST00000449186 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.45■□□□□ 0.86
RPRD1B-202ENST00000449186 NCAPD3P42695 1498 aa20.37■□□□□ 0.85
RPRD1B-202ENST00000449186 WIZO95785 1651 aa20.35■□□□□ 0.85
RPRD1B-202ENST00000449186 SMARCA2P51531 1590 aa20.35■□□□□ 0.85
RPRD1B-202ENST00000449186 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
RPRD1B-202ENST00000449186 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.33■□□□□ 0.84
RPRD1B-202ENST00000449186 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RPRD1B-202ENST00000449186 HMGXB3Q12766 1538 aa20.26■□□□□ 0.83
RPRD1B-202ENST00000449186 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
RPRD1B-202ENST00000449186 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
RPRD1B-202ENST00000449186 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
RPRD1B-202ENST00000449186 NESP48681 1621 aa19.98■□□□□ 0.79
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.87■□□□□ 0.77
RPRD1B-202ENST00000449186 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.8■□□□□ 0.76
RPRD1B-202ENST00000449186 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.78■□□□□ 0.76
RPRD1B-202ENST00000449186 ERCC6Q03468 1493 aa19.73■□□□□ 0.75
RPRD1B-202ENST00000449186 CFTRP13569 1480 aa19.71■□□□□ 0.75
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.7■□□□□ 0.74
RPRD1B-202ENST00000449186 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.64■□□□□ 0.73
RPRD1B-202ENST00000449186 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.6■□□□□ 0.73
RPRD1B-202ENST00000449186 PRDM2Q13029 1718 aa19.56■□□□□ 0.72
RPRD1B-202ENST00000449186 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.53■□□□□ 0.72
RPRD1B-202ENST00000449186 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.48■□□□□ 0.71
RPRD1B-202ENST00000449186 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR62O43379 1518 aa19.41■□□□□ 0.7
RPRD1B-202ENST00000449186 CUX2O14529 1486 aa19.4■□□□□ 0.7
RPRD1B-202ENST00000449186 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.39■□□□□ 0.69
RPRD1B-202ENST00000449186 TOPBP1Q92547 1522 aa19.31■□□□□ 0.68
RPRD1B-202ENST00000449186 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.27■□□□□ 0.67
RPRD1B-202ENST00000449186 CUX1P39880 1505 aa19.25■□□□□ 0.67
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCC8Q09428 1581 aa19.25■□□□□ 0.67
RPRD1B-202ENST00000449186 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
RPRD1B-202ENST00000449186 SYNJ1O43426 1573 aa19.15■□□□□ 0.66
RPRD1B-202ENST00000449186 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.15■□□□□ 0.66
RPRD1B-202ENST00000449186 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.14■□□□□ 0.65
RPRD1B-202ENST00000449186 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.65
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
RPRD1B-202ENST00000449186 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
RPRD1B-202ENST00000449186 IFT140Q96RY7 1462 aa19.09■□□□□ 0.65
RPRD1B-202ENST00000449186 SOGA1O94964 1423 aa19.08■□□□□ 0.64
RPRD1B-202ENST00000449186 TOP2BQ02880 1626 aa19.07■□□□□ 0.64
RPRD1B-202ENST00000449186 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.07■□□□□ 0.64
RPRD1B-202ENST00000449186 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.636e-10■■□□□ 11.9
RPRD1B-202ENST00000449186 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
RPRD1B-202ENST00000449186 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
RPRD1B-202ENST00000449186 WDR97A6NE52 1622 aa18.97■□□□□ 0.63
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.92■□□□□ 0.62
RPRD1B-202ENST00000449186 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.85■□□□□ 0.61
RPRD1B-202ENST00000449186 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.84■□□□□ 0.61
RPRD1B-202ENST00000449186 PBRM1Q86U86 1689 aa18.82■□□□□ 0.6
RPRD1B-202ENST00000449186 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.81■□□□□ 0.6
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM41Q8WV44 630 aa18.8■□□□□ 0.6
RPRD1B-202ENST00000449186 GRIN2BQ13224 1484 aa18.79■□□□□ 0.6
RPRD1B-202ENST00000449186 CHD1O14646 1710 aa18.76■□□□□ 0.59
RPRD1B-202ENST00000449186 FBLN2P98095 1184 aa18.75■□□□□ 0.59
RPRD1B-202ENST00000449186 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.74■□□□□ 0.59
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.71■□□□□ 0.59
RPRD1B-202ENST00000449186 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF27Q86VH2 1401 aa18.68■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 OSCARQ8IYS5 282 aa18.67■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAMTS12P58397 1594 aa18.67■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.66■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 IGF1RP08069 1367 aa18.66■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 SYNJ2O15056 1496 aa18.65■□□□□ 0.58
RPRD1B-202ENST00000449186 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.6■□□□□ 0.57
RPRD1B-202ENST00000449186 GRIN2AQ12879 1464 aa18.58■□□□□ 0.56
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP170Q5SW79 1584 aa18.53■□□□□ 0.56
RPRD1B-202ENST00000449186 CUL7Q14999 1698 aa18.52■□□□□ 0.56
RPRD1B-202ENST00000449186 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.52■□□□□ 0.55
RPRD1B-202ENST00000449186 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.51■□□□□ 0.55
RPRD1B-202ENST00000449186 NUP160Q12769 1436 aa18.48■□□□□ 0.55
RPRD1B-202ENST00000449186 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.42■□□□□ 0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.41■□□□□ 0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.41■□□□□ 0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.41■□□□□ 0.54
RPRD1B-202ENST00000449186 ARHGEF11O15085 1522 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms