Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 STK11IP-213ENST00000494777 705 ntTSL 215.57■□□□□ 0.084e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PECR-207ENST00000487318 742 ntTSL 514.11□□□□□ -0.154e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.34e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 STK11IP-202ENST00000447191 705 ntTSL 313.09□□□□□ -0.314e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SCAP-210ENST00000468965 570 ntTSL 212.92□□□□□ -0.344e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PECR-206ENST00000474093 585 ntTSL 212.62□□□□□ -0.394e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PKD1P6-NPIPP1-201ENST00000340301 547 ntTSL 511.99□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-212ENST00000520542 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.54e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 211.56□□□□□ -0.564e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-205ENST00000418519 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.574e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-209ENST00000479136 2209 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.634e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GPRC5C-209ENST00000582444 550 ntTSL 410.28□□□□□ -0.764e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-208ENST00000477054 4655 ntTSL 510.07□□□□□ -0.84e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-203ENST00000394175 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.884e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 OSGEP-202ENST00000553292 530 ntTSL 29.18□□□□□ -0.944e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-204ENST00000394179 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.194e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-215ENST00000524039 1100 ntTSL 26.94□□□□□ -1.34e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-213ENST00000522564 958 ntTSL 26.93□□□□□ -1.34e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-214ENST00000523371 1127 ntTSL 26.93□□□□□ -1.34e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ELP2-224ENST00000543861 555 ntTSL 46.23□□□□□ -1.412e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PECR-204ENST00000464722 640 ntTSL 46.1□□□□□ -1.434e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-211ENST00000519429 616 ntTSL 55.87□□□□□ -1.474e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 GSDMB-207ENST00000468820 369 ntTSL 54.49□□□□□ -1.694e-8■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ELP2-217ENST00000541294 883 ntTSL 52.42□□□□□ -2.023e-18■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CR1L-204ENST00000530905 930 ntTSL 520.47■□□□□ 0.872e-11■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CR1L-203ENST00000508064 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.632e-11■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 CR1L-201ENST00000294997 1587 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.272e-11■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.219e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.449e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.399e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PTP4A1-203ENST00000473334 638 ntTSL 321.32■■□□□ 19e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 220.97■□□□□ 0.959e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.929e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.849e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.849e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.89e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.749e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.669e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.619e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.589e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 COX20-205ENST00000498262 2290 ntTSL 218.09■□□□□ 0.499e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-207ENST00000539927 354 ntTSL 218.01■□□□□ 0.479e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SH3GL1-205ENST00000598230 577 ntTSL 517.66■□□□□ 0.429e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 MED16-208ENST00000592373 927 ntTSL 317.51■□□□□ 0.399e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ITGA6-204ENST00000412899 970 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.399e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UXS1-206ENST00000441952 570 ntTSL 217.42■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UXS1-208ENST00000457835 682 ntTSL 417.42■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UXS1-214ENST00000483426 541 ntTSL 417.42■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 FBXW4-202ENST00000457105 630 ntTSL 517.12■□□□□ 0.339e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.329e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.289e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.279e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.229e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 PPP1R37-203ENST00000496125 555 ntTSL 316.27■□□□□ 0.29e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.199e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 216.1■□□□□ 0.179e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ITIH3-204ENST00000464804 543 ntTSL 415.94■□□□□ 0.149e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.149e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.139e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RAB11FIP3-208ENST00000464263 329 ntTSL 314.88□□□□□ -0.039e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.069e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ABCC6-207ENST00000577103 1381 ntTSL 514.67□□□□□ -0.069e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.139e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.149e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-204ENST00000553368 304 ntTSL 313.93□□□□□ -0.189e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.29e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.219e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.229e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 AKAP1-217ENST00000576295 614 ntTSL 313.63□□□□□ -0.239e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.259e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 COX20-202ENST00000391839 1005 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.269e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 SH3GL1-203ENST00000593591 1036 ntTSL 413.36□□□□□ -0.279e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-216ENST00000557159 1803 ntTSL 213.06□□□□□ -0.329e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.339e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-208ENST00000554813 654 ntTSL 312.61□□□□□ -0.399e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-211ENST00000555839 952 ntTSL 212.61□□□□□ -0.399e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 312.41□□□□□ -0.429e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-213ENST00000556296 571 ntTSL 412.4□□□□□ -0.429e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-207ENST00000554325 568 ntTSL 512.39□□□□□ -0.439e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-217ENST00000557181 566 ntTSL 312.39□□□□□ -0.439e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 ITGA6-203ENST00000409532 3544 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.519e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 511.88□□□□□ -0.519e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-212ENST00000556054 773 ntTSL 311.88□□□□□ -0.519e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 311.88□□□□□ -0.519e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RNF34-205ENST00000554484 1603 ntTSL 211.69□□□□□ -0.549e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.569e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.569e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 RPL32-203ENST00000396957 1749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.619e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 FANCA-217ENST00000564969 850 ntTSL 311.24□□□□□ -0.619e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-220ENST00000557592 640 ntTSL 511.12□□□□□ -0.639e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-204ENST00000534969 532 ntTSL 311.01□□□□□ -0.659e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-205ENST00000537833 561 ntTSL 311.01□□□□□ -0.659e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-209ENST00000543941 539 ntTSL 310.74□□□□□ -0.699e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 C1RL-208ENST00000543933 592 ntTSL 510.61□□□□□ -0.719e-6■□□□□ 9.6
EFTUD2Q15029 APEX1-206ENST00000553681 899 ntTSL 310.5□□□□□ -0.739e-6■□□□□ 9.6
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